Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vat1Q62465 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vat1Q62465 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vat1Q62465 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vat1Q62465 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vat1Q62465 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vat1Q62465 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vat1Q62465 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vat1Q62465 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vat1Q62465 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vat1Q62465 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vat1Q62465 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vat1Q62465 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vat1Q62465 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vat1Q62465 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vat1Q62465 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vat1Q62465 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vat1Q62465 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vat1Q62465 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vat1Q62465 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vat1Q62465 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vat1Q62465 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vat1Q62465 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vat1Q62465 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vat1Q62465 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vat1Q62465 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vat1Q62465 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vat1Q62465 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vat1Q62465 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vat1Q62465 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vat1Q62465 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vat1Q62465 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vat1Q62465 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Vat1Q62465 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vat1Q62465 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vat1Q62465 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vat1Q62465 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vat1Q62465 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Vat1Q62465 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vat1Q62465 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vat1Q62465 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vat1Q62465 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vat1Q62465 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vat1Q62465 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Vat1Q62465 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Vat1Q62465 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vat1Q62465 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vat1Q62465 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vat1Q62465 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vat1Q62465 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vat1Q62465 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vat1Q62465 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vat1Q62465 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vat1Q62465 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Vat1Q62465 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vat1Q62465 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vat1Q62465 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vat1Q62465 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vat1Q62465 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vat1Q62465 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vat1Q62465 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vat1Q62465 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vat1Q62465 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vat1Q62465 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vat1Q62465 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vat1Q62465 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vat1Q62465 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vat1Q62465 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vat1Q62465 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vat1Q62465 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Vat1Q62465 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Vat1Q62465 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vat1Q62465 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vat1Q62465 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vat1Q62465 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vat1Q62465 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vat1Q62465 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Vat1Q62465 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vat1Q62465 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vat1Q62465 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vat1Q62465 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vat1Q62465 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vat1Q62465 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vat1Q62465 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vat1Q62465 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vat1Q62465 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vat1Q62465 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vat1Q62465 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vat1Q62465 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vat1Q62465 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vat1Q62465 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vat1Q62465 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vat1Q62465 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vat1Q62465 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vat1Q62465 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vat1Q62465 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vat1Q62465 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vat1Q62465 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vat1Q62465 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Vat1Q62465 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms