Protein–RNA interactions for Protein: Q62383

Supt6h, Transcription elongation factor SPT6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt6hQ62383 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Supt6hQ62383 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Supt6hQ62383 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Supt6hQ62383 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Supt6hQ62383 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Supt6hQ62383 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Supt6hQ62383 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Supt6hQ62383 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Supt6hQ62383 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Supt6hQ62383 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Supt6hQ62383 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Supt6hQ62383 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Supt6hQ62383 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC26.08■■□□□ 1.76
Supt6hQ62383 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Supt6hQ62383 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Supt6hQ62383 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Supt6hQ62383 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Supt6hQ62383 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Supt6hQ62383 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Supt6hQ62383 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Supt6hQ62383 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Supt6hQ62383 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Supt6hQ62383 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Supt6hQ62383 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Supt6hQ62383 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Supt6hQ62383 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Supt6hQ62383 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Supt6hQ62383 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Supt6hQ62383 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Supt6hQ62383 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Supt6hQ62383 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Supt6hQ62383 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Supt6hQ62383 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Supt6hQ62383 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Supt6hQ62383 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Supt6hQ62383 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Supt6hQ62383 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Supt6hQ62383 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Supt6hQ62383 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Supt6hQ62383 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Supt6hQ62383 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Supt6hQ62383 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Supt6hQ62383 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Supt6hQ62383 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Supt6hQ62383 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Supt6hQ62383 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Supt6hQ62383 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Supt6hQ62383 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Supt6hQ62383 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Supt6hQ62383 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Supt6hQ62383 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Supt6hQ62383 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Supt6hQ62383 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Supt6hQ62383 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Supt6hQ62383 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Supt6hQ62383 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Supt6hQ62383 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Supt6hQ62383 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Supt6hQ62383 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Supt6hQ62383 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Supt6hQ62383 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Supt6hQ62383 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Supt6hQ62383 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Supt6hQ62383 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Supt6hQ62383 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Supt6hQ62383 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Supt6hQ62383 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Supt6hQ62383 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Supt6hQ62383 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Supt6hQ62383 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Supt6hQ62383 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Supt6hQ62383 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Supt6hQ62383 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Supt6hQ62383 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Supt6hQ62383 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Supt6hQ62383 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Supt6hQ62383 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Supt6hQ62383 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Supt6hQ62383 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Supt6hQ62383 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Supt6hQ62383 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Supt6hQ62383 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Supt6hQ62383 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Supt6hQ62383 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Supt6hQ62383 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Supt6hQ62383 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Supt6hQ62383 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Supt6hQ62383 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Supt6hQ62383 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Supt6hQ62383 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Supt6hQ62383 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Supt6hQ62383 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Supt6hQ62383 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Supt6hQ62383 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Supt6hQ62383 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Supt6hQ62383 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Supt6hQ62383 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Supt6hQ62383 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Supt6hQ62383 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Supt6hQ62383 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms