Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sall3Q62255 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sall3Q62255 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sall3Q62255 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sall3Q62255 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sall3Q62255 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sall3Q62255 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sall3Q62255 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sall3Q62255 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sall3Q62255 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sall3Q62255 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Sall3Q62255 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Sall3Q62255 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sall3Q62255 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sall3Q62255 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sall3Q62255 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sall3Q62255 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sall3Q62255 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sall3Q62255 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sall3Q62255 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Sall3Q62255 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sall3Q62255 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sall3Q62255 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sall3Q62255 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sall3Q62255 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sall3Q62255 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sall3Q62255 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sall3Q62255 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sall3Q62255 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Sall3Q62255 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sall3Q62255 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sall3Q62255 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sall3Q62255 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sall3Q62255 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sall3Q62255 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sall3Q62255 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sall3Q62255 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sall3Q62255 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sall3Q62255 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sall3Q62255 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Sall3Q62255 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sall3Q62255 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sall3Q62255 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sall3Q62255 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sall3Q62255 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Sall3Q62255 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Sall3Q62255 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Sall3Q62255 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Sall3Q62255 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Sall3Q62255 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sall3Q62255 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sall3Q62255 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sall3Q62255 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sall3Q62255 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sall3Q62255 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sall3Q62255 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sall3Q62255 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sall3Q62255 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sall3Q62255 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sall3Q62255 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sall3Q62255 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sall3Q62255 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sall3Q62255 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sall3Q62255 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sall3Q62255 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sall3Q62255 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sall3Q62255 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sall3Q62255 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sall3Q62255 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sall3Q62255 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Sall3Q62255 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sall3Q62255 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sall3Q62255 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sall3Q62255 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sall3Q62255 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sall3Q62255 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sall3Q62255 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sall3Q62255 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sall3Q62255 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sall3Q62255 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sall3Q62255 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sall3Q62255 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sall3Q62255 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sall3Q62255 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sall3Q62255 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sall3Q62255 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sall3Q62255 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sall3Q62255 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sall3Q62255 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sall3Q62255 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sall3Q62255 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sall3Q62255 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sall3Q62255 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sall3Q62255 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sall3Q62255 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sall3Q62255 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sall3Q62255 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sall3Q62255 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sall3Q62255 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sall3Q62255 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms