Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itga6Q61739 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itga6Q61739 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itga6Q61739 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itga6Q61739 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itga6Q61739 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itga6Q61739 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itga6Q61739 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itga6Q61739 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itga6Q61739 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itga6Q61739 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itga6Q61739 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itga6Q61739 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itga6Q61739 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itga6Q61739 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itga6Q61739 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itga6Q61739 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itga6Q61739 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itga6Q61739 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itga6Q61739 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itga6Q61739 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itga6Q61739 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Itga6Q61739 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itga6Q61739 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Itga6Q61739 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itga6Q61739 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itga6Q61739 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itga6Q61739 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itga6Q61739 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itga6Q61739 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itga6Q61739 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itga6Q61739 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itga6Q61739 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itga6Q61739 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itga6Q61739 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itga6Q61739 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Itga6Q61739 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itga6Q61739 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itga6Q61739 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itga6Q61739 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itga6Q61739 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itga6Q61739 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itga6Q61739 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Itga6Q61739 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Itga6Q61739 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Itga6Q61739 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Itga6Q61739 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Itga6Q61739 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Itga6Q61739 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Itga6Q61739 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Itga6Q61739 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itga6Q61739 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itga6Q61739 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itga6Q61739 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itga6Q61739 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itga6Q61739 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Itga6Q61739 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Itga6Q61739 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Itga6Q61739 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Itga6Q61739 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Itga6Q61739 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Itga6Q61739 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Itga6Q61739 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Itga6Q61739 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Itga6Q61739 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Itga6Q61739 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Itga6Q61739 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Itga6Q61739 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Itga6Q61739 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itga6Q61739 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itga6Q61739 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itga6Q61739 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itga6Q61739 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itga6Q61739 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Itga6Q61739 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Itga6Q61739 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Itga6Q61739 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Itga6Q61739 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Itga6Q61739 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Itga6Q61739 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Itga6Q61739 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Itga6Q61739 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Itga6Q61739 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Itga6Q61739 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Itga6Q61739 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Itga6Q61739 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Itga6Q61739 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Itga6Q61739 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Itga6Q61739 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Itga6Q61739 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Itga6Q61739 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Itga6Q61739 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Itga6Q61739 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Itga6Q61739 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Itga6Q61739 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Itga6Q61739 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Itga6Q61739 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Itga6Q61739 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Itga6Q61739 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Itga6Q61739 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms