Protein–RNA interactions for Protein: Q61738

Itga7, Integrin alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga7Q61738 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga7Q61738 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga7Q61738 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga7Q61738 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga7Q61738 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga7Q61738 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga7Q61738 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga7Q61738 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga7Q61738 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga7Q61738 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga7Q61738 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga7Q61738 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga7Q61738 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga7Q61738 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga7Q61738 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga7Q61738 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga7Q61738 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga7Q61738 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga7Q61738 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga7Q61738 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga7Q61738 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga7Q61738 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga7Q61738 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga7Q61738 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga7Q61738 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga7Q61738 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga7Q61738 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga7Q61738 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga7Q61738 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga7Q61738 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga7Q61738 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga7Q61738 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga7Q61738 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga7Q61738 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga7Q61738 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga7Q61738 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga7Q61738 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga7Q61738 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga7Q61738 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga7Q61738 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga7Q61738 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga7Q61738 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga7Q61738 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga7Q61738 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga7Q61738 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga7Q61738 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga7Q61738 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga7Q61738 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itga7Q61738 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itga7Q61738 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itga7Q61738 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itga7Q61738 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itga7Q61738 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itga7Q61738 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itga7Q61738 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itga7Q61738 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Itga7Q61738 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itga7Q61738 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Itga7Q61738 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itga7Q61738 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itga7Q61738 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itga7Q61738 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itga7Q61738 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itga7Q61738 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Itga7Q61738 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga7Q61738 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga7Q61738 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga7Q61738 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga7Q61738 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga7Q61738 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga7Q61738 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga7Q61738 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga7Q61738 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga7Q61738 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga7Q61738 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga7Q61738 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga7Q61738 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga7Q61738 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga7Q61738 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga7Q61738 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga7Q61738 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga7Q61738 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga7Q61738 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga7Q61738 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itga7Q61738 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itga7Q61738 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Itga7Q61738 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itga7Q61738 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Itga7Q61738 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Itga7Q61738 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Itga7Q61738 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itga7Q61738 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itga7Q61738 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itga7Q61738 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itga7Q61738 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itga7Q61738 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itga7Q61738 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Itga7Q61738 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itga7Q61738 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itga7Q61738 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms