Protein–RNA interactions for Protein: Q61735

Cd47, Leukocyte surface antigen CD47, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd47Q61735 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd47Q61735 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd47Q61735 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd47Q61735 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd47Q61735 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd47Q61735 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd47Q61735 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd47Q61735 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd47Q61735 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd47Q61735 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd47Q61735 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd47Q61735 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd47Q61735 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd47Q61735 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd47Q61735 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd47Q61735 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd47Q61735 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd47Q61735 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd47Q61735 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd47Q61735 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd47Q61735 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd47Q61735 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd47Q61735 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd47Q61735 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd47Q61735 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd47Q61735 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd47Q61735 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd47Q61735 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd47Q61735 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd47Q61735 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd47Q61735 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd47Q61735 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd47Q61735 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd47Q61735 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd47Q61735 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd47Q61735 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd47Q61735 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd47Q61735 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd47Q61735 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd47Q61735 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd47Q61735 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd47Q61735 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd47Q61735 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd47Q61735 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd47Q61735 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd47Q61735 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd47Q61735 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd47Q61735 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd47Q61735 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd47Q61735 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd47Q61735 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd47Q61735 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd47Q61735 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd47Q61735 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd47Q61735 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd47Q61735 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd47Q61735 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd47Q61735 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd47Q61735 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd47Q61735 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd47Q61735 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd47Q61735 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd47Q61735 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd47Q61735 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd47Q61735 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd47Q61735 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd47Q61735 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd47Q61735 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd47Q61735 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd47Q61735 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd47Q61735 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd47Q61735 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd47Q61735 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd47Q61735 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd47Q61735 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd47Q61735 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd47Q61735 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd47Q61735 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd47Q61735 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd47Q61735 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd47Q61735 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd47Q61735 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd47Q61735 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd47Q61735 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd47Q61735 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd47Q61735 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd47Q61735 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd47Q61735 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd47Q61735 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd47Q61735 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd47Q61735 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd47Q61735 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd47Q61735 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd47Q61735 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd47Q61735 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd47Q61735 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd47Q61735 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd47Q61735 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd47Q61735 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd47Q61735 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms