Protein–RNA interactions for Protein: Q61451

Cd53, Leukocyte surface antigen CD53, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd53Q61451 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd53Q61451 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd53Q61451 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd53Q61451 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd53Q61451 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd53Q61451 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd53Q61451 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd53Q61451 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd53Q61451 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd53Q61451 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd53Q61451 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd53Q61451 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd53Q61451 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd53Q61451 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd53Q61451 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd53Q61451 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd53Q61451 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd53Q61451 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd53Q61451 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd53Q61451 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd53Q61451 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd53Q61451 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd53Q61451 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd53Q61451 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cd53Q61451 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cd53Q61451 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cd53Q61451 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd53Q61451 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd53Q61451 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd53Q61451 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd53Q61451 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd53Q61451 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd53Q61451 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd53Q61451 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd53Q61451 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd53Q61451 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd53Q61451 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd53Q61451 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd53Q61451 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd53Q61451 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd53Q61451 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd53Q61451 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd53Q61451 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd53Q61451 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd53Q61451 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd53Q61451 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd53Q61451 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd53Q61451 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd53Q61451 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd53Q61451 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd53Q61451 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd53Q61451 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd53Q61451 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd53Q61451 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd53Q61451 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd53Q61451 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd53Q61451 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd53Q61451 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd53Q61451 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd53Q61451 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd53Q61451 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd53Q61451 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd53Q61451 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd53Q61451 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd53Q61451 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd53Q61451 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd53Q61451 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd53Q61451 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd53Q61451 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd53Q61451 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd53Q61451 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd53Q61451 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd53Q61451 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd53Q61451 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd53Q61451 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd53Q61451 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd53Q61451 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd53Q61451 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd53Q61451 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd53Q61451 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd53Q61451 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd53Q61451 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd53Q61451 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd53Q61451 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd53Q61451 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd53Q61451 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd53Q61451 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd53Q61451 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd53Q61451 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd53Q61451 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd53Q61451 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd53Q61451 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd53Q61451 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd53Q61451 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd53Q61451 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd53Q61451 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd53Q61451 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd53Q61451 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd53Q61451 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd53Q61451 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms