Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

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Length 883 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BcanQ61361 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BcanQ61361 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BcanQ61361 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BcanQ61361 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BcanQ61361 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BcanQ61361 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BcanQ61361 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BcanQ61361 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BcanQ61361 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BcanQ61361 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BcanQ61361 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BcanQ61361 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BcanQ61361 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
BcanQ61361 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BcanQ61361 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BcanQ61361 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
BcanQ61361 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
BcanQ61361 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
BcanQ61361 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
BcanQ61361 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BcanQ61361 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BcanQ61361 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BcanQ61361 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BcanQ61361 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BcanQ61361 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BcanQ61361 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BcanQ61361 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BcanQ61361 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BcanQ61361 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BcanQ61361 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BcanQ61361 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BcanQ61361 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BcanQ61361 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BcanQ61361 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BcanQ61361 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BcanQ61361 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BcanQ61361 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BcanQ61361 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BcanQ61361 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BcanQ61361 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BcanQ61361 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BcanQ61361 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BcanQ61361 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BcanQ61361 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
BcanQ61361 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BcanQ61361 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BcanQ61361 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BcanQ61361 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
BcanQ61361 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BcanQ61361 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BcanQ61361 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BcanQ61361 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BcanQ61361 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BcanQ61361 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BcanQ61361 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BcanQ61361 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BcanQ61361 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BcanQ61361 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BcanQ61361 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BcanQ61361 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BcanQ61361 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BcanQ61361 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BcanQ61361 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
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BcanQ61361 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BcanQ61361 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BcanQ61361 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BcanQ61361 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BcanQ61361 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BcanQ61361 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BcanQ61361 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BcanQ61361 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BcanQ61361 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BcanQ61361 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BcanQ61361 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
BcanQ61361 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BcanQ61361 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BcanQ61361 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BcanQ61361 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BcanQ61361 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BcanQ61361 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BcanQ61361 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BcanQ61361 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
BcanQ61361 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BcanQ61361 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BcanQ61361 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BcanQ61361 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BcanQ61361 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BcanQ61361 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BcanQ61361 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BcanQ61361 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BcanQ61361 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BcanQ61361 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BcanQ61361 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BcanQ61361 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BcanQ61361 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BcanQ61361 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BcanQ61361 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22■■□□□ 1.11
BcanQ61361 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms