Protein–RNA interactions for Protein: Q61146

Ocln, Occludin, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OclnQ61146 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OclnQ61146 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OclnQ61146 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
OclnQ61146 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OclnQ61146 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OclnQ61146 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OclnQ61146 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OclnQ61146 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OclnQ61146 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OclnQ61146 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OclnQ61146 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
OclnQ61146 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
OclnQ61146 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OclnQ61146 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OclnQ61146 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OclnQ61146 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
OclnQ61146 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
OclnQ61146 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
OclnQ61146 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OclnQ61146 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OclnQ61146 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OclnQ61146 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OclnQ61146 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
OclnQ61146 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OclnQ61146 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OclnQ61146 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OclnQ61146 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OclnQ61146 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OclnQ61146 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OclnQ61146 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OclnQ61146 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OclnQ61146 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OclnQ61146 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OclnQ61146 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OclnQ61146 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OclnQ61146 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OclnQ61146 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OclnQ61146 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OclnQ61146 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OclnQ61146 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OclnQ61146 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OclnQ61146 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OclnQ61146 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OclnQ61146 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OclnQ61146 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OclnQ61146 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OclnQ61146 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OclnQ61146 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OclnQ61146 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OclnQ61146 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OclnQ61146 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OclnQ61146 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OclnQ61146 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OclnQ61146 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OclnQ61146 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OclnQ61146 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OclnQ61146 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
OclnQ61146 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
OclnQ61146 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OclnQ61146 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
OclnQ61146 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OclnQ61146 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OclnQ61146 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
OclnQ61146 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OclnQ61146 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
OclnQ61146 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OclnQ61146 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OclnQ61146 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OclnQ61146 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
OclnQ61146 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OclnQ61146 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OclnQ61146 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OclnQ61146 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OclnQ61146 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OclnQ61146 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OclnQ61146 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OclnQ61146 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OclnQ61146 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OclnQ61146 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OclnQ61146 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OclnQ61146 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OclnQ61146 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OclnQ61146 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OclnQ61146 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OclnQ61146 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OclnQ61146 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
OclnQ61146 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
OclnQ61146 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OclnQ61146 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
OclnQ61146 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OclnQ61146 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OclnQ61146 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
OclnQ61146 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
OclnQ61146 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
OclnQ61146 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OclnQ61146 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OclnQ61146 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OclnQ61146 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OclnQ61146 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OclnQ61146 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms