Protein–RNA interactions for Protein: Q61033

Tmpo, Lamina-associated polypeptide 2, isoforms alpha/zeta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TmpoQ61033 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TmpoQ61033 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TmpoQ61033 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TmpoQ61033 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TmpoQ61033 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TmpoQ61033 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TmpoQ61033 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TmpoQ61033 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TmpoQ61033 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TmpoQ61033 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TmpoQ61033 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TmpoQ61033 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TmpoQ61033 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TmpoQ61033 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TmpoQ61033 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TmpoQ61033 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TmpoQ61033 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TmpoQ61033 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TmpoQ61033 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TmpoQ61033 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TmpoQ61033 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TmpoQ61033 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TmpoQ61033 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TmpoQ61033 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TmpoQ61033 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TmpoQ61033 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TmpoQ61033 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TmpoQ61033 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TmpoQ61033 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TmpoQ61033 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TmpoQ61033 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TmpoQ61033 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TmpoQ61033 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TmpoQ61033 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TmpoQ61033 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TmpoQ61033 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TmpoQ61033 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TmpoQ61033 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TmpoQ61033 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TmpoQ61033 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TmpoQ61033 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TmpoQ61033 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TmpoQ61033 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TmpoQ61033 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TmpoQ61033 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TmpoQ61033 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TmpoQ61033 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TmpoQ61033 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TmpoQ61033 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TmpoQ61033 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TmpoQ61033 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TmpoQ61033 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TmpoQ61033 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TmpoQ61033 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TmpoQ61033 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TmpoQ61033 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TmpoQ61033 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TmpoQ61033 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TmpoQ61033 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TmpoQ61033 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TmpoQ61033 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TmpoQ61033 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TmpoQ61033 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TmpoQ61033 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TmpoQ61033 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TmpoQ61033 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TmpoQ61033 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TmpoQ61033 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TmpoQ61033 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TmpoQ61033 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TmpoQ61033 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TmpoQ61033 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TmpoQ61033 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TmpoQ61033 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TmpoQ61033 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TmpoQ61033 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TmpoQ61033 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TmpoQ61033 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TmpoQ61033 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TmpoQ61033 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TmpoQ61033 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TmpoQ61033 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TmpoQ61033 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TmpoQ61033 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TmpoQ61033 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TmpoQ61033 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TmpoQ61033 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TmpoQ61033 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TmpoQ61033 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TmpoQ61033 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TmpoQ61033 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TmpoQ61033 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TmpoQ61033 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TmpoQ61033 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TmpoQ61033 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TmpoQ61033 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TmpoQ61033 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TmpoQ61033 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TmpoQ61033 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TmpoQ61033 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms