Protein–RNA interactions for Protein: Q60954

Meis1, Homeobox protein Meis1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis1Q60954 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Meis1Q60954 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Meis1Q60954 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Meis1Q60954 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Meis1Q60954 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Meis1Q60954 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Meis1Q60954 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Meis1Q60954 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Meis1Q60954 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Meis1Q60954 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Meis1Q60954 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Meis1Q60954 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Meis1Q60954 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Meis1Q60954 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Meis1Q60954 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Meis1Q60954 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Meis1Q60954 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Meis1Q60954 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Meis1Q60954 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Meis1Q60954 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Meis1Q60954 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Meis1Q60954 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Meis1Q60954 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Meis1Q60954 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Meis1Q60954 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Meis1Q60954 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Meis1Q60954 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Meis1Q60954 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Meis1Q60954 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Meis1Q60954 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Meis1Q60954 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Meis1Q60954 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Meis1Q60954 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Meis1Q60954 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Meis1Q60954 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Meis1Q60954 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Meis1Q60954 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Meis1Q60954 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Meis1Q60954 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Meis1Q60954 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Meis1Q60954 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Meis1Q60954 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Meis1Q60954 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Meis1Q60954 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Meis1Q60954 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Meis1Q60954 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Meis1Q60954 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Meis1Q60954 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Meis1Q60954 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Meis1Q60954 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Meis1Q60954 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Meis1Q60954 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Meis1Q60954 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Meis1Q60954 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Meis1Q60954 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Meis1Q60954 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Meis1Q60954 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Meis1Q60954 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Meis1Q60954 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Meis1Q60954 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Meis1Q60954 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Meis1Q60954 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Meis1Q60954 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Meis1Q60954 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Meis1Q60954 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Meis1Q60954 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Meis1Q60954 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Meis1Q60954 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Meis1Q60954 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Meis1Q60954 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Meis1Q60954 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Meis1Q60954 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Meis1Q60954 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Meis1Q60954 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Meis1Q60954 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Meis1Q60954 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Meis1Q60954 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Meis1Q60954 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Meis1Q60954 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Meis1Q60954 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Meis1Q60954 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Meis1Q60954 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Meis1Q60954 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Meis1Q60954 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Meis1Q60954 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Meis1Q60954 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Meis1Q60954 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Meis1Q60954 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Meis1Q60954 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Meis1Q60954 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Meis1Q60954 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Meis1Q60954 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Meis1Q60954 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Meis1Q60954 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Meis1Q60954 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Meis1Q60954 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Meis1Q60954 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Meis1Q60954 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Meis1Q60954 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Meis1Q60954 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms