Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Foxd4Q60688 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Foxd4Q60688 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Foxd4Q60688 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Foxd4Q60688 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Foxd4Q60688 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Foxd4Q60688 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Foxd4Q60688 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Foxd4Q60688 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Foxd4Q60688 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Foxd4Q60688 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Foxd4Q60688 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Foxd4Q60688 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Foxd4Q60688 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Foxd4Q60688 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Foxd4Q60688 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Foxd4Q60688 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Foxd4Q60688 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Foxd4Q60688 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Foxd4Q60688 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Foxd4Q60688 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Foxd4Q60688 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Foxd4Q60688 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Foxd4Q60688 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Foxd4Q60688 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Foxd4Q60688 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Foxd4Q60688 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Foxd4Q60688 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Foxd4Q60688 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Foxd4Q60688 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Foxd4Q60688 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Foxd4Q60688 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Foxd4Q60688 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Foxd4Q60688 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Foxd4Q60688 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Foxd4Q60688 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Foxd4Q60688 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Foxd4Q60688 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Foxd4Q60688 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Foxd4Q60688 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Foxd4Q60688 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Foxd4Q60688 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Foxd4Q60688 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Foxd4Q60688 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Foxd4Q60688 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Foxd4Q60688 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Foxd4Q60688 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Foxd4Q60688 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Foxd4Q60688 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Foxd4Q60688 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Foxd4Q60688 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Foxd4Q60688 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Foxd4Q60688 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Foxd4Q60688 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Foxd4Q60688 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Foxd4Q60688 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Foxd4Q60688 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Foxd4Q60688 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Foxd4Q60688 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Foxd4Q60688 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Foxd4Q60688 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Foxd4Q60688 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Foxd4Q60688 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Foxd4Q60688 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Foxd4Q60688 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Foxd4Q60688 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Foxd4Q60688 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Foxd4Q60688 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Foxd4Q60688 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Foxd4Q60688 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Foxd4Q60688 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Foxd4Q60688 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Foxd4Q60688 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Foxd4Q60688 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Foxd4Q60688 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Foxd4Q60688 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Foxd4Q60688 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Foxd4Q60688 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Foxd4Q60688 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Foxd4Q60688 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Foxd4Q60688 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Foxd4Q60688 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Foxd4Q60688 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Foxd4Q60688 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Foxd4Q60688 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Foxd4Q60688 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Foxd4Q60688 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Foxd4Q60688 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Foxd4Q60688 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Foxd4Q60688 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Foxd4Q60688 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Foxd4Q60688 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Foxd4Q60688 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Foxd4Q60688 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Foxd4Q60688 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Foxd4Q60688 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Foxd4Q60688 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Foxd4Q60688 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Foxd4Q60688 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Foxd4Q60688 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms