Protein–RNA interactions for Protein: Q60611

Satb1, DNA-binding protein SATB1, mousemouse

Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Satb1Q60611 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Satb1Q60611 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Satb1Q60611 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Satb1Q60611 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Satb1Q60611 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Satb1Q60611 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Satb1Q60611 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Satb1Q60611 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Satb1Q60611 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Satb1Q60611 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Satb1Q60611 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Satb1Q60611 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Satb1Q60611 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Satb1Q60611 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Satb1Q60611 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Satb1Q60611 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Satb1Q60611 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Satb1Q60611 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Satb1Q60611 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Satb1Q60611 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Satb1Q60611 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Satb1Q60611 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Satb1Q60611 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Satb1Q60611 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Satb1Q60611 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Satb1Q60611 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Satb1Q60611 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Satb1Q60611 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Satb1Q60611 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Satb1Q60611 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Satb1Q60611 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Satb1Q60611 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Satb1Q60611 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Satb1Q60611 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Satb1Q60611 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Satb1Q60611 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Satb1Q60611 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Satb1Q60611 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Satb1Q60611 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Satb1Q60611 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Satb1Q60611 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Satb1Q60611 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Satb1Q60611 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Satb1Q60611 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Satb1Q60611 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Satb1Q60611 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Satb1Q60611 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Satb1Q60611 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Satb1Q60611 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Satb1Q60611 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Satb1Q60611 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Satb1Q60611 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Satb1Q60611 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Satb1Q60611 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Satb1Q60611 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Satb1Q60611 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Satb1Q60611 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Satb1Q60611 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Satb1Q60611 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Satb1Q60611 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Satb1Q60611 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Satb1Q60611 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Satb1Q60611 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Satb1Q60611 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Satb1Q60611 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Satb1Q60611 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Satb1Q60611 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Satb1Q60611 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Satb1Q60611 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Satb1Q60611 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Satb1Q60611 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Satb1Q60611 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Satb1Q60611 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Satb1Q60611 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Satb1Q60611 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Satb1Q60611 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Satb1Q60611 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Satb1Q60611 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Satb1Q60611 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Satb1Q60611 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Satb1Q60611 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Satb1Q60611 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Satb1Q60611 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Satb1Q60611 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Satb1Q60611 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Satb1Q60611 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Satb1Q60611 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Satb1Q60611 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Satb1Q60611 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Satb1Q60611 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Satb1Q60611 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Satb1Q60611 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Satb1Q60611 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Satb1Q60611 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Satb1Q60611 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Satb1Q60611 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Satb1Q60611 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Satb1Q60611 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Satb1Q60611 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Satb1Q60611 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms