Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CttnQ60598 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CttnQ60598 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CttnQ60598 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CttnQ60598 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CttnQ60598 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CttnQ60598 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CttnQ60598 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CttnQ60598 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CttnQ60598 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CttnQ60598 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CttnQ60598 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CttnQ60598 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CttnQ60598 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CttnQ60598 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CttnQ60598 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CttnQ60598 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CttnQ60598 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CttnQ60598 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CttnQ60598 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CttnQ60598 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CttnQ60598 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CttnQ60598 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CttnQ60598 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CttnQ60598 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CttnQ60598 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CttnQ60598 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CttnQ60598 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CttnQ60598 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CttnQ60598 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CttnQ60598 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CttnQ60598 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CttnQ60598 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CttnQ60598 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CttnQ60598 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CttnQ60598 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CttnQ60598 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CttnQ60598 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CttnQ60598 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CttnQ60598 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CttnQ60598 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CttnQ60598 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CttnQ60598 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CttnQ60598 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CttnQ60598 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CttnQ60598 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CttnQ60598 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CttnQ60598 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CttnQ60598 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CttnQ60598 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CttnQ60598 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CttnQ60598 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CttnQ60598 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CttnQ60598 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CttnQ60598 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CttnQ60598 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CttnQ60598 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CttnQ60598 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CttnQ60598 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CttnQ60598 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CttnQ60598 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CttnQ60598 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CttnQ60598 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CttnQ60598 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CttnQ60598 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CttnQ60598 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CttnQ60598 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CttnQ60598 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CttnQ60598 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CttnQ60598 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CttnQ60598 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CttnQ60598 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CttnQ60598 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CttnQ60598 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CttnQ60598 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CttnQ60598 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CttnQ60598 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CttnQ60598 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CttnQ60598 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CttnQ60598 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CttnQ60598 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CttnQ60598 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CttnQ60598 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CttnQ60598 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CttnQ60598 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CttnQ60598 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CttnQ60598 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CttnQ60598 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CttnQ60598 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CttnQ60598 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CttnQ60598 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CttnQ60598 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CttnQ60598 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CttnQ60598 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CttnQ60598 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CttnQ60598 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CttnQ60598 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CttnQ60598 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CttnQ60598 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CttnQ60598 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms