Protein–RNA interactions for Protein: Q5UBV8

Tnfsf15, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 15, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf15Q5UBV8 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tnfsf15Q5UBV8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tnfsf15Q5UBV8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tnfsf15Q5UBV8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tnfsf15Q5UBV8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tnfsf15Q5UBV8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tnfsf15Q5UBV8 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tnfsf15Q5UBV8 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tnfsf15Q5UBV8 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tnfsf15Q5UBV8 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tnfsf15Q5UBV8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Tnfsf15Q5UBV8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tnfsf15Q5UBV8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tnfsf15Q5UBV8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tnfsf15Q5UBV8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tnfsf15Q5UBV8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tnfsf15Q5UBV8 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tnfsf15Q5UBV8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tnfsf15Q5UBV8 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tnfsf15Q5UBV8 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tnfsf15Q5UBV8 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tnfsf15Q5UBV8 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tnfsf15Q5UBV8 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tnfsf15Q5UBV8 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tnfsf15Q5UBV8 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tnfsf15Q5UBV8 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms