Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D8

Slc5a6, Sodium-dependent multivitamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a6Q5U4D8 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc5a6Q5U4D8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc5a6Q5U4D8 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc5a6Q5U4D8 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc5a6Q5U4D8 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc5a6Q5U4D8 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc5a6Q5U4D8 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc5a6Q5U4D8 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc5a6Q5U4D8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc5a6Q5U4D8 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc5a6Q5U4D8 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc5a6Q5U4D8 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc5a6Q5U4D8 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc5a6Q5U4D8 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc5a6Q5U4D8 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc5a6Q5U4D8 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc5a6Q5U4D8 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc5a6Q5U4D8 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc5a6Q5U4D8 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc5a6Q5U4D8 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc5a6Q5U4D8 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc5a6Q5U4D8 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc5a6Q5U4D8 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc5a6Q5U4D8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc5a6Q5U4D8 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms