Protein–RNA interactions for Protein: Q5U465

Ccdc125, Coiled-coil domain-containing protein 125, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc125Q5U465 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc125Q5U465 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc125Q5U465 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc125Q5U465 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc125Q5U465 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc125Q5U465 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc125Q5U465 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc125Q5U465 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc125Q5U465 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc125Q5U465 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc125Q5U465 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc125Q5U465 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc125Q5U465 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc125Q5U465 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc125Q5U465 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc125Q5U465 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc125Q5U465 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc125Q5U465 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc125Q5U465 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc125Q5U465 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc125Q5U465 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc125Q5U465 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc125Q5U465 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc125Q5U465 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc125Q5U465 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc125Q5U465 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc125Q5U465 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc125Q5U465 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc125Q5U465 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc125Q5U465 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc125Q5U465 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc125Q5U465 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc125Q5U465 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc125Q5U465 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc125Q5U465 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc125Q5U465 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc125Q5U465 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc125Q5U465 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc125Q5U465 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc125Q5U465 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc125Q5U465 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc125Q5U465 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc125Q5U465 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc125Q5U465 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc125Q5U465 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc125Q5U465 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc125Q5U465 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc125Q5U465 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc125Q5U465 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc125Q5U465 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc125Q5U465 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc125Q5U465 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc125Q5U465 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc125Q5U465 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc125Q5U465 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc125Q5U465 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc125Q5U465 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc125Q5U465 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc125Q5U465 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc125Q5U465 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc125Q5U465 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc125Q5U465 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc125Q5U465 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc125Q5U465 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc125Q5U465 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc125Q5U465 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc125Q5U465 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc125Q5U465 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc125Q5U465 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc125Q5U465 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc125Q5U465 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc125Q5U465 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc125Q5U465 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc125Q5U465 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc125Q5U465 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc125Q5U465 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc125Q5U465 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc125Q5U465 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc125Q5U465 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc125Q5U465 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc125Q5U465 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc125Q5U465 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc125Q5U465 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc125Q5U465 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc125Q5U465 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc125Q5U465 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc125Q5U465 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc125Q5U465 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc125Q5U465 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc125Q5U465 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc125Q5U465 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc125Q5U465 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc125Q5U465 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc125Q5U465 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc125Q5U465 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc125Q5U465 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc125Q5U465 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc125Q5U465 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc125Q5U465 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc125Q5U465 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms