Protein–RNA interactions for Protein: Q5SX40

Myh1, Myosin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,942 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myh1Q5SX40 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Myh1Q5SX40 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
Myh1Q5SX40 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
Myh1Q5SX40 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Myh1Q5SX40 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Myh1Q5SX40 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Myh1Q5SX40 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Myh1Q5SX40 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Myh1Q5SX40 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Myh1Q5SX40 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Myh1Q5SX40 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Myh1Q5SX40 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Myh1Q5SX40 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Myh1Q5SX40 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Myh1Q5SX40 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Myh1Q5SX40 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Myh1Q5SX40 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Myh1Q5SX40 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Myh1Q5SX40 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Myh1Q5SX40 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Myh1Q5SX40 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Myh1Q5SX40 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Myh1Q5SX40 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Myh1Q5SX40 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Myh1Q5SX40 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Myh1Q5SX40 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Myh1Q5SX40 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Myh1Q5SX40 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Myh1Q5SX40 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Myh1Q5SX40 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Myh1Q5SX40 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Myh1Q5SX40 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Myh1Q5SX40 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Myh1Q5SX40 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Myh1Q5SX40 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Myh1Q5SX40 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Myh1Q5SX40 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Myh1Q5SX40 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Myh1Q5SX40 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Myh1Q5SX40 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Myh1Q5SX40 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Myh1Q5SX40 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Myh1Q5SX40 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Myh1Q5SX40 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Myh1Q5SX40 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Myh1Q5SX40 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Myh1Q5SX40 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Myh1Q5SX40 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Myh1Q5SX40 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Myh1Q5SX40 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Myh1Q5SX40 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Myh1Q5SX40 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Myh1Q5SX40 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Myh1Q5SX40 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Myh1Q5SX40 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Myh1Q5SX40 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Myh1Q5SX40 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Myh1Q5SX40 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Myh1Q5SX40 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Myh1Q5SX40 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Myh1Q5SX40 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Myh1Q5SX40 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Myh1Q5SX40 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Myh1Q5SX40 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Myh1Q5SX40 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Myh1Q5SX40 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Myh1Q5SX40 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Myh1Q5SX40 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Myh1Q5SX40 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Myh1Q5SX40 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Myh1Q5SX40 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Myh1Q5SX40 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Myh1Q5SX40 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Myh1Q5SX40 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Myh1Q5SX40 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Myh1Q5SX40 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Myh1Q5SX40 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Myh1Q5SX40 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Myh1Q5SX40 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Myh1Q5SX40 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Myh1Q5SX40 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Myh1Q5SX40 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Myh1Q5SX40 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Myh1Q5SX40 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Myh1Q5SX40 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Myh1Q5SX40 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Myh1Q5SX40 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Myh1Q5SX40 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Myh1Q5SX40 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Myh1Q5SX40 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Myh1Q5SX40 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Myh1Q5SX40 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Myh1Q5SX40 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Myh1Q5SX40 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Myh1Q5SX40 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Myh1Q5SX40 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Myh1Q5SX40 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Myh1Q5SX40 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Myh1Q5SX40 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Myh1Q5SX40 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms