Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD5

Vmn1r196, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r196Q5SVD5 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r196Q5SVD5 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r196Q5SVD5 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r196Q5SVD5 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r196Q5SVD5 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r196Q5SVD5 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r196Q5SVD5 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r196Q5SVD5 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r196Q5SVD5 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r196Q5SVD5 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r196Q5SVD5 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r196Q5SVD5 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r196Q5SVD5 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r196Q5SVD5 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r196Q5SVD5 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r196Q5SVD5 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r196Q5SVD5 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r196Q5SVD5 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r196Q5SVD5 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r196Q5SVD5 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r196Q5SVD5 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r196Q5SVD5 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r196Q5SVD5 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r196Q5SVD5 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r196Q5SVD5 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r196Q5SVD5 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r196Q5SVD5 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r196Q5SVD5 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r196Q5SVD5 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r196Q5SVD5 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r196Q5SVD5 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r196Q5SVD5 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms