Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Trim41Q5NCC3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Trim41Q5NCC3 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Trim41Q5NCC3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Trim41Q5NCC3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Trim41Q5NCC3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Trim41Q5NCC3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Trim41Q5NCC3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
Trim41Q5NCC3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Trim41Q5NCC3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Trim41Q5NCC3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Trim41Q5NCC3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Trim41Q5NCC3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Trim41Q5NCC3 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Trim41Q5NCC3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Trim41Q5NCC3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Trim41Q5NCC3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Trim41Q5NCC3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Trim41Q5NCC3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Trim41Q5NCC3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Trim41Q5NCC3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Trim41Q5NCC3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Trim41Q5NCC3 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Trim41Q5NCC3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
Trim41Q5NCC3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Trim41Q5NCC3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Trim41Q5NCC3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Trim41Q5NCC3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Trim41Q5NCC3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Trim41Q5NCC3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Trim41Q5NCC3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Trim41Q5NCC3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Trim41Q5NCC3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Trim41Q5NCC3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Trim41Q5NCC3 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Trim41Q5NCC3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Trim41Q5NCC3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Trim41Q5NCC3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Trim41Q5NCC3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Trim41Q5NCC3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Trim41Q5NCC3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Trim41Q5NCC3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Trim41Q5NCC3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Trim41Q5NCC3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Trim41Q5NCC3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Trim41Q5NCC3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Trim41Q5NCC3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Trim41Q5NCC3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Trim41Q5NCC3 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Trim41Q5NCC3 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Trim41Q5NCC3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Trim41Q5NCC3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Trim41Q5NCC3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
Trim41Q5NCC3 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Trim41Q5NCC3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Trim41Q5NCC3 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Trim41Q5NCC3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Trim41Q5NCC3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Trim41Q5NCC3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Trim41Q5NCC3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Trim41Q5NCC3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Trim41Q5NCC3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
Trim41Q5NCC3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Trim41Q5NCC3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Trim41Q5NCC3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Trim41Q5NCC3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Trim41Q5NCC3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Trim41Q5NCC3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Trim41Q5NCC3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Trim41Q5NCC3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Trim41Q5NCC3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Trim41Q5NCC3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Trim41Q5NCC3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Trim41Q5NCC3 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Trim41Q5NCC3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Trim41Q5NCC3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Trim41Q5NCC3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Trim41Q5NCC3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Trim41Q5NCC3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Trim41Q5NCC3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Trim41Q5NCC3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Trim41Q5NCC3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Trim41Q5NCC3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Trim41Q5NCC3 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Trim41Q5NCC3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Trim41Q5NCC3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Trim41Q5NCC3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Trim41Q5NCC3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Trim41Q5NCC3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
Trim41Q5NCC3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Trim41Q5NCC3 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Trim41Q5NCC3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Trim41Q5NCC3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Trim41Q5NCC3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Trim41Q5NCC3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
Trim41Q5NCC3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Trim41Q5NCC3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Trim41Q5NCC3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Trim41Q5NCC3 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Trim41Q5NCC3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 385.9 ms