Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZH7

Slc38a8, Putative sodium-coupled neutral amino acid transporter 8, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a8Q5HZH7 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc38a8Q5HZH7 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc38a8Q5HZH7 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc38a8Q5HZH7 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc38a8Q5HZH7 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc38a8Q5HZH7 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc38a8Q5HZH7 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc38a8Q5HZH7 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Slc38a8Q5HZH7 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc38a8Q5HZH7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Slc38a8Q5HZH7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Slc38a8Q5HZH7 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc38a8Q5HZH7 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc38a8Q5HZH7 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc38a8Q5HZH7 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc38a8Q5HZH7 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Slc38a8Q5HZH7 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Slc38a8Q5HZH7 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc38a8Q5HZH7 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc38a8Q5HZH7 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc38a8Q5HZH7 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc38a8Q5HZH7 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Slc38a8Q5HZH7 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc38a8Q5HZH7 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Slc38a8Q5HZH7 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc38a8Q5HZH7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Slc38a8Q5HZH7 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Slc38a8Q5HZH7 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Slc38a8Q5HZH7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Slc38a8Q5HZH7 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc38a8Q5HZH7 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Slc38a8Q5HZH7 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc38a8Q5HZH7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc38a8Q5HZH7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc38a8Q5HZH7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc38a8Q5HZH7 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc38a8Q5HZH7 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc38a8Q5HZH7 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc38a8Q5HZH7 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc38a8Q5HZH7 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc38a8Q5HZH7 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc38a8Q5HZH7 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc38a8Q5HZH7 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc38a8Q5HZH7 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc38a8Q5HZH7 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc38a8Q5HZH7 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Slc38a8Q5HZH7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc38a8Q5HZH7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc38a8Q5HZH7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc38a8Q5HZH7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc38a8Q5HZH7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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