Protein–RNA interactions for Protein: Q571G4

Lin54, Protein lin-54 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin54Q571G4 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Lin54Q571G4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lin54Q571G4 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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Lin54Q571G4 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lin54Q571G4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lin54Q571G4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Lin54Q571G4 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lin54Q571G4 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lin54Q571G4 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lin54Q571G4 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Lin54Q571G4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Lin54Q571G4 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lin54Q571G4 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lin54Q571G4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lin54Q571G4 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lin54Q571G4 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lin54Q571G4 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Lin54Q571G4 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin54Q571G4 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Lin54Q571G4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Lin54Q571G4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Lin54Q571G4 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lin54Q571G4 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lin54Q571G4 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin54Q571G4 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin54Q571G4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin54Q571G4 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin54Q571G4 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin54Q571G4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin54Q571G4 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin54Q571G4 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin54Q571G4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin54Q571G4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin54Q571G4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin54Q571G4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin54Q571G4 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin54Q571G4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin54Q571G4 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin54Q571G4 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin54Q571G4 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin54Q571G4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin54Q571G4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin54Q571G4 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin54Q571G4 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin54Q571G4 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin54Q571G4 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin54Q571G4 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin54Q571G4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin54Q571G4 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin54Q571G4 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin54Q571G4 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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