Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR2

Lrig2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig2Q52KR2 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrig2Q52KR2 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrig2Q52KR2 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrig2Q52KR2 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrig2Q52KR2 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrig2Q52KR2 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrig2Q52KR2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrig2Q52KR2 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrig2Q52KR2 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrig2Q52KR2 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrig2Q52KR2 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrig2Q52KR2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrig2Q52KR2 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrig2Q52KR2 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrig2Q52KR2 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrig2Q52KR2 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrig2Q52KR2 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrig2Q52KR2 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrig2Q52KR2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrig2Q52KR2 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrig2Q52KR2 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrig2Q52KR2 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrig2Q52KR2 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrig2Q52KR2 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrig2Q52KR2 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrig2Q52KR2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrig2Q52KR2 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrig2Q52KR2 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrig2Q52KR2 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrig2Q52KR2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrig2Q52KR2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrig2Q52KR2 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrig2Q52KR2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrig2Q52KR2 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrig2Q52KR2 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrig2Q52KR2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrig2Q52KR2 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrig2Q52KR2 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrig2Q52KR2 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrig2Q52KR2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrig2Q52KR2 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrig2Q52KR2 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrig2Q52KR2 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrig2Q52KR2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrig2Q52KR2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrig2Q52KR2 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrig2Q52KR2 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrig2Q52KR2 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrig2Q52KR2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrig2Q52KR2 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrig2Q52KR2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrig2Q52KR2 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrig2Q52KR2 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrig2Q52KR2 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrig2Q52KR2 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrig2Q52KR2 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrig2Q52KR2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrig2Q52KR2 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrig2Q52KR2 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrig2Q52KR2 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrig2Q52KR2 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrig2Q52KR2 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrig2Q52KR2 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrig2Q52KR2 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrig2Q52KR2 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrig2Q52KR2 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrig2Q52KR2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrig2Q52KR2 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrig2Q52KR2 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrig2Q52KR2 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrig2Q52KR2 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrig2Q52KR2 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrig2Q52KR2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrig2Q52KR2 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrig2Q52KR2 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrig2Q52KR2 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrig2Q52KR2 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrig2Q52KR2 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrig2Q52KR2 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrig2Q52KR2 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrig2Q52KR2 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrig2Q52KR2 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrig2Q52KR2 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrig2Q52KR2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrig2Q52KR2 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrig2Q52KR2 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrig2Q52KR2 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrig2Q52KR2 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lrig2Q52KR2 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lrig2Q52KR2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lrig2Q52KR2 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lrig2Q52KR2 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lrig2Q52KR2 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrig2Q52KR2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrig2Q52KR2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrig2Q52KR2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrig2Q52KR2 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrig2Q52KR2 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrig2Q52KR2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrig2Q52KR2 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms