Protein–RNA interactions for Protein: Q4U4S6

Xirp2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp2Q4U4S6 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xirp2Q4U4S6 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xirp2Q4U4S6 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xirp2Q4U4S6 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xirp2Q4U4S6 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xirp2Q4U4S6 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xirp2Q4U4S6 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xirp2Q4U4S6 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Xirp2Q4U4S6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xirp2Q4U4S6 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xirp2Q4U4S6 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xirp2Q4U4S6 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xirp2Q4U4S6 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xirp2Q4U4S6 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xirp2Q4U4S6 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xirp2Q4U4S6 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xirp2Q4U4S6 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xirp2Q4U4S6 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xirp2Q4U4S6 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Xirp2Q4U4S6 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xirp2Q4U4S6 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xirp2Q4U4S6 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xirp2Q4U4S6 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Xirp2Q4U4S6 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Xirp2Q4U4S6 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Xirp2Q4U4S6 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Xirp2Q4U4S6 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Xirp2Q4U4S6 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Xirp2Q4U4S6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Xirp2Q4U4S6 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Xirp2Q4U4S6 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Xirp2Q4U4S6 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Xirp2Q4U4S6 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Xirp2Q4U4S6 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Xirp2Q4U4S6 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Xirp2Q4U4S6 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Xirp2Q4U4S6 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Xirp2Q4U4S6 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Xirp2Q4U4S6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Xirp2Q4U4S6 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Xirp2Q4U4S6 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Xirp2Q4U4S6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Xirp2Q4U4S6 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Xirp2Q4U4S6 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Xirp2Q4U4S6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Xirp2Q4U4S6 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Xirp2Q4U4S6 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Xirp2Q4U4S6 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Xirp2Q4U4S6 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Xirp2Q4U4S6 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Xirp2Q4U4S6 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Xirp2Q4U4S6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Xirp2Q4U4S6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Xirp2Q4U4S6 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Xirp2Q4U4S6 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Xirp2Q4U4S6 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Xirp2Q4U4S6 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Xirp2Q4U4S6 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Xirp2Q4U4S6 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Xirp2Q4U4S6 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Xirp2Q4U4S6 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Xirp2Q4U4S6 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Xirp2Q4U4S6 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Xirp2Q4U4S6 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Xirp2Q4U4S6 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Xirp2Q4U4S6 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Xirp2Q4U4S6 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Xirp2Q4U4S6 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Xirp2Q4U4S6 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Xirp2Q4U4S6 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Xirp2Q4U4S6 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Xirp2Q4U4S6 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Xirp2Q4U4S6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Xirp2Q4U4S6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Xirp2Q4U4S6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Xirp2Q4U4S6 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Xirp2Q4U4S6 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Xirp2Q4U4S6 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Xirp2Q4U4S6 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Xirp2Q4U4S6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Xirp2Q4U4S6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Xirp2Q4U4S6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Xirp2Q4U4S6 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Xirp2Q4U4S6 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Xirp2Q4U4S6 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Xirp2Q4U4S6 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Xirp2Q4U4S6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Xirp2Q4U4S6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Xirp2Q4U4S6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Xirp2Q4U4S6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Xirp2Q4U4S6 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Xirp2Q4U4S6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Xirp2Q4U4S6 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Xirp2Q4U4S6 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Xirp2Q4U4S6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Xirp2Q4U4S6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Xirp2Q4U4S6 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Xirp2Q4U4S6 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Xirp2Q4U4S6 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Xirp2Q4U4S6 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms