Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc185Q3V118 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc185Q3V118 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc185Q3V118 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc185Q3V118 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc185Q3V118 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc185Q3V118 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc185Q3V118 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc185Q3V118 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc185Q3V118 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc185Q3V118 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc185Q3V118 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc185Q3V118 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc185Q3V118 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc185Q3V118 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc185Q3V118 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc185Q3V118 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc185Q3V118 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc185Q3V118 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc185Q3V118 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc185Q3V118 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc185Q3V118 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc185Q3V118 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc185Q3V118 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc185Q3V118 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc185Q3V118 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc185Q3V118 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc185Q3V118 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc185Q3V118 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc185Q3V118 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc185Q3V118 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc185Q3V118 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc185Q3V118 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc185Q3V118 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc185Q3V118 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc185Q3V118 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc185Q3V118 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc185Q3V118 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc185Q3V118 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc185Q3V118 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc185Q3V118 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc185Q3V118 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc185Q3V118 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc185Q3V118 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc185Q3V118 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc185Q3V118 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc185Q3V118 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc185Q3V118 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc185Q3V118 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc185Q3V118 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc185Q3V118 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc185Q3V118 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc185Q3V118 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc185Q3V118 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc185Q3V118 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc185Q3V118 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc185Q3V118 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc185Q3V118 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc185Q3V118 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc185Q3V118 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc185Q3V118 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc185Q3V118 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc185Q3V118 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc185Q3V118 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc185Q3V118 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc185Q3V118 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc185Q3V118 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc185Q3V118 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc185Q3V118 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc185Q3V118 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc185Q3V118 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc185Q3V118 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc185Q3V118 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc185Q3V118 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc185Q3V118 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc185Q3V118 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc185Q3V118 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc185Q3V118 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc185Q3V118 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc185Q3V118 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc185Q3V118 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc185Q3V118 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc185Q3V118 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc185Q3V118 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc185Q3V118 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc185Q3V118 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc185Q3V118 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc185Q3V118 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc185Q3V118 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc185Q3V118 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc185Q3V118 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc185Q3V118 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc185Q3V118 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc185Q3V118 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc185Q3V118 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc185Q3V118 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc185Q3V118 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc185Q3V118 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc185Q3V118 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc185Q3V118 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms