Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc27Q3V036 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc27Q3V036 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc27Q3V036 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc27Q3V036 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc27Q3V036 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc27Q3V036 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc27Q3V036 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc27Q3V036 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc27Q3V036 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc27Q3V036 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc27Q3V036 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc27Q3V036 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc27Q3V036 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc27Q3V036 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc27Q3V036 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc27Q3V036 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc27Q3V036 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc27Q3V036 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc27Q3V036 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc27Q3V036 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc27Q3V036 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc27Q3V036 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc27Q3V036 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc27Q3V036 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc27Q3V036 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc27Q3V036 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc27Q3V036 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc27Q3V036 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc27Q3V036 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc27Q3V036 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc27Q3V036 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc27Q3V036 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc27Q3V036 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc27Q3V036 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc27Q3V036 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc27Q3V036 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc27Q3V036 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc27Q3V036 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc27Q3V036 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc27Q3V036 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc27Q3V036 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc27Q3V036 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc27Q3V036 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc27Q3V036 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc27Q3V036 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc27Q3V036 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc27Q3V036 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc27Q3V036 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc27Q3V036 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc27Q3V036 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc27Q3V036 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc27Q3V036 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc27Q3V036 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ccdc27Q3V036 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ccdc27Q3V036 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc27Q3V036 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc27Q3V036 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc27Q3V036 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc27Q3V036 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc27Q3V036 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc27Q3V036 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc27Q3V036 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc27Q3V036 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc27Q3V036 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc27Q3V036 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc27Q3V036 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc27Q3V036 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc27Q3V036 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc27Q3V036 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc27Q3V036 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc27Q3V036 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc27Q3V036 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc27Q3V036 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc27Q3V036 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc27Q3V036 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc27Q3V036 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc27Q3V036 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc27Q3V036 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc27Q3V036 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc27Q3V036 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc27Q3V036 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc27Q3V036 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc27Q3V036 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc27Q3V036 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc27Q3V036 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc27Q3V036 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc27Q3V036 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc27Q3V036 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc27Q3V036 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc27Q3V036 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc27Q3V036 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc27Q3V036 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc27Q3V036 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc27Q3V036 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc27Q3V036 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc27Q3V036 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc27Q3V036 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc27Q3V036 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc27Q3V036 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms