Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU56

Gm29609, Predicted gene 29609, mousemouse

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Length 907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29609Q3UU56 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gm29609Q3UU56 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gm29609Q3UU56 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gm29609Q3UU56 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gm29609Q3UU56 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm29609Q3UU56 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm29609Q3UU56 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm29609Q3UU56 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm29609Q3UU56 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm29609Q3UU56 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm29609Q3UU56 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm29609Q3UU56 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm29609Q3UU56 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm29609Q3UU56 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm29609Q3UU56 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm29609Q3UU56 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm29609Q3UU56 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm29609Q3UU56 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm29609Q3UU56 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm29609Q3UU56 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm29609Q3UU56 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm29609Q3UU56 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm29609Q3UU56 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm29609Q3UU56 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm29609Q3UU56 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm29609Q3UU56 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Gm29609Q3UU56 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm29609Q3UU56 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Gm29609Q3UU56 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm29609Q3UU56 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm29609Q3UU56 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm29609Q3UU56 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm29609Q3UU56 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Gm29609Q3UU56 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm29609Q3UU56 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm29609Q3UU56 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm29609Q3UU56 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm29609Q3UU56 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm29609Q3UU56 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm29609Q3UU56 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm29609Q3UU56 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm29609Q3UU56 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm29609Q3UU56 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm29609Q3UU56 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm29609Q3UU56 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm29609Q3UU56 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm29609Q3UU56 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm29609Q3UU56 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm29609Q3UU56 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm29609Q3UU56 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm29609Q3UU56 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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Gm29609Q3UU56 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm29609Q3UU56 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm29609Q3UU56 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm29609Q3UU56 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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Gm29609Q3UU56 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm29609Q3UU56 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm29609Q3UU56 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm29609Q3UU56 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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Gm29609Q3UU56 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm29609Q3UU56 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm29609Q3UU56 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm29609Q3UU56 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm29609Q3UU56 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm29609Q3UU56 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm29609Q3UU56 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm29609Q3UU56 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm29609Q3UU56 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm29609Q3UU56 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm29609Q3UU56 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm29609Q3UU56 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm29609Q3UU56 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm29609Q3UU56 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm29609Q3UU56 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm29609Q3UU56 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm29609Q3UU56 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm29609Q3UU56 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm29609Q3UU56 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm29609Q3UU56 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
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