Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU43

Chpf2, Hexosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chpf2Q3UU43 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Chpf2Q3UU43 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Chpf2Q3UU43 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chpf2Q3UU43 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chpf2Q3UU43 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chpf2Q3UU43 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chpf2Q3UU43 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chpf2Q3UU43 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Chpf2Q3UU43 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chpf2Q3UU43 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chpf2Q3UU43 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chpf2Q3UU43 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chpf2Q3UU43 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chpf2Q3UU43 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chpf2Q3UU43 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chpf2Q3UU43 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chpf2Q3UU43 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chpf2Q3UU43 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chpf2Q3UU43 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chpf2Q3UU43 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chpf2Q3UU43 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chpf2Q3UU43 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chpf2Q3UU43 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chpf2Q3UU43 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chpf2Q3UU43 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Chpf2Q3UU43 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chpf2Q3UU43 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chpf2Q3UU43 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chpf2Q3UU43 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chpf2Q3UU43 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chpf2Q3UU43 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chpf2Q3UU43 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chpf2Q3UU43 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Chpf2Q3UU43 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chpf2Q3UU43 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chpf2Q3UU43 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chpf2Q3UU43 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chpf2Q3UU43 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chpf2Q3UU43 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chpf2Q3UU43 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Chpf2Q3UU43 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Chpf2Q3UU43 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chpf2Q3UU43 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chpf2Q3UU43 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chpf2Q3UU43 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chpf2Q3UU43 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chpf2Q3UU43 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chpf2Q3UU43 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chpf2Q3UU43 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chpf2Q3UU43 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chpf2Q3UU43 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chpf2Q3UU43 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chpf2Q3UU43 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chpf2Q3UU43 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chpf2Q3UU43 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chpf2Q3UU43 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chpf2Q3UU43 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chpf2Q3UU43 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Chpf2Q3UU43 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chpf2Q3UU43 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chpf2Q3UU43 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chpf2Q3UU43 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chpf2Q3UU43 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chpf2Q3UU43 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chpf2Q3UU43 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chpf2Q3UU43 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chpf2Q3UU43 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chpf2Q3UU43 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chpf2Q3UU43 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Chpf2Q3UU43 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chpf2Q3UU43 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chpf2Q3UU43 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chpf2Q3UU43 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chpf2Q3UU43 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Chpf2Q3UU43 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chpf2Q3UU43 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chpf2Q3UU43 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chpf2Q3UU43 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chpf2Q3UU43 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chpf2Q3UU43 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chpf2Q3UU43 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chpf2Q3UU43 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chpf2Q3UU43 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chpf2Q3UU43 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chpf2Q3UU43 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chpf2Q3UU43 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chpf2Q3UU43 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chpf2Q3UU43 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chpf2Q3UU43 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chpf2Q3UU43 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chpf2Q3UU43 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chpf2Q3UU43 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chpf2Q3UU43 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chpf2Q3UU43 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chpf2Q3UU43 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chpf2Q3UU43 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Chpf2Q3UU43 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Chpf2Q3UU43 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Chpf2Q3UU43 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chpf2Q3UU43 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms