Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP44

Nhlrc4, NHL-repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc4Q3UP44 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nhlrc4Q3UP44 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nhlrc4Q3UP44 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nhlrc4Q3UP44 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nhlrc4Q3UP44 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nhlrc4Q3UP44 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nhlrc4Q3UP44 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nhlrc4Q3UP44 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nhlrc4Q3UP44 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nhlrc4Q3UP44 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nhlrc4Q3UP44 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nhlrc4Q3UP44 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nhlrc4Q3UP44 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nhlrc4Q3UP44 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nhlrc4Q3UP44 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nhlrc4Q3UP44 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nhlrc4Q3UP44 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nhlrc4Q3UP44 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nhlrc4Q3UP44 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nhlrc4Q3UP44 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nhlrc4Q3UP44 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nhlrc4Q3UP44 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nhlrc4Q3UP44 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nhlrc4Q3UP44 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nhlrc4Q3UP44 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nhlrc4Q3UP44 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nhlrc4Q3UP44 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nhlrc4Q3UP44 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nhlrc4Q3UP44 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nhlrc4Q3UP44 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nhlrc4Q3UP44 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nhlrc4Q3UP44 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nhlrc4Q3UP44 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nhlrc4Q3UP44 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nhlrc4Q3UP44 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nhlrc4Q3UP44 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nhlrc4Q3UP44 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nhlrc4Q3UP44 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nhlrc4Q3UP44 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nhlrc4Q3UP44 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nhlrc4Q3UP44 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nhlrc4Q3UP44 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nhlrc4Q3UP44 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nhlrc4Q3UP44 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nhlrc4Q3UP44 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nhlrc4Q3UP44 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nhlrc4Q3UP44 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nhlrc4Q3UP44 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nhlrc4Q3UP44 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nhlrc4Q3UP44 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nhlrc4Q3UP44 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nhlrc4Q3UP44 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nhlrc4Q3UP44 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nhlrc4Q3UP44 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nhlrc4Q3UP44 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nhlrc4Q3UP44 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nhlrc4Q3UP44 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nhlrc4Q3UP44 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nhlrc4Q3UP44 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nhlrc4Q3UP44 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nhlrc4Q3UP44 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nhlrc4Q3UP44 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nhlrc4Q3UP44 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nhlrc4Q3UP44 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nhlrc4Q3UP44 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nhlrc4Q3UP44 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nhlrc4Q3UP44 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nhlrc4Q3UP44 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nhlrc4Q3UP44 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nhlrc4Q3UP44 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nhlrc4Q3UP44 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nhlrc4Q3UP44 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nhlrc4Q3UP44 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nhlrc4Q3UP44 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nhlrc4Q3UP44 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nhlrc4Q3UP44 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nhlrc4Q3UP44 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nhlrc4Q3UP44 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nhlrc4Q3UP44 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nhlrc4Q3UP44 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nhlrc4Q3UP44 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nhlrc4Q3UP44 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nhlrc4Q3UP44 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nhlrc4Q3UP44 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nhlrc4Q3UP44 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nhlrc4Q3UP44 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nhlrc4Q3UP44 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nhlrc4Q3UP44 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nhlrc4Q3UP44 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nhlrc4Q3UP44 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nhlrc4Q3UP44 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nhlrc4Q3UP44 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nhlrc4Q3UP44 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nhlrc4Q3UP44 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Nhlrc4Q3UP44 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nhlrc4Q3UP44 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nhlrc4Q3UP44 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Nhlrc4Q3UP44 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nhlrc4Q3UP44 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nhlrc4Q3UP44 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms