Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cog7Q3UM29 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cog7Q3UM29 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cog7Q3UM29 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cog7Q3UM29 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cog7Q3UM29 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cog7Q3UM29 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cog7Q3UM29 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cog7Q3UM29 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cog7Q3UM29 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cog7Q3UM29 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cog7Q3UM29 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cog7Q3UM29 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cog7Q3UM29 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cog7Q3UM29 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cog7Q3UM29 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cog7Q3UM29 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cog7Q3UM29 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cog7Q3UM29 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cog7Q3UM29 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cog7Q3UM29 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cog7Q3UM29 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cog7Q3UM29 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cog7Q3UM29 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cog7Q3UM29 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cog7Q3UM29 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cog7Q3UM29 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cog7Q3UM29 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cog7Q3UM29 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cog7Q3UM29 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cog7Q3UM29 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cog7Q3UM29 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cog7Q3UM29 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cog7Q3UM29 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cog7Q3UM29 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cog7Q3UM29 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cog7Q3UM29 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cog7Q3UM29 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cog7Q3UM29 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cog7Q3UM29 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cog7Q3UM29 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cog7Q3UM29 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cog7Q3UM29 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cog7Q3UM29 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cog7Q3UM29 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cog7Q3UM29 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cog7Q3UM29 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cog7Q3UM29 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cog7Q3UM29 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cog7Q3UM29 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cog7Q3UM29 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cog7Q3UM29 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cog7Q3UM29 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cog7Q3UM29 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cog7Q3UM29 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cog7Q3UM29 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cog7Q3UM29 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cog7Q3UM29 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cog7Q3UM29 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cog7Q3UM29 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cog7Q3UM29 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cog7Q3UM29 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cog7Q3UM29 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cog7Q3UM29 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cog7Q3UM29 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cog7Q3UM29 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cog7Q3UM29 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cog7Q3UM29 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cog7Q3UM29 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cog7Q3UM29 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cog7Q3UM29 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cog7Q3UM29 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cog7Q3UM29 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cog7Q3UM29 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cog7Q3UM29 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cog7Q3UM29 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cog7Q3UM29 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cog7Q3UM29 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cog7Q3UM29 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cog7Q3UM29 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cog7Q3UM29 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cog7Q3UM29 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cog7Q3UM29 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cog7Q3UM29 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cog7Q3UM29 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cog7Q3UM29 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cog7Q3UM29 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cog7Q3UM29 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cog7Q3UM29 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cog7Q3UM29 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cog7Q3UM29 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cog7Q3UM29 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cog7Q3UM29 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cog7Q3UM29 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cog7Q3UM29 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cog7Q3UM29 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cog7Q3UM29 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cog7Q3UM29 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cog7Q3UM29 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cog7Q3UM29 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms