Protein–RNA interactions for Protein: Q3UK78

Pcgf5, Polycomb group RING finger protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf5Q3UK78 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pcgf5Q3UK78 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pcgf5Q3UK78 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pcgf5Q3UK78 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pcgf5Q3UK78 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pcgf5Q3UK78 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pcgf5Q3UK78 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pcgf5Q3UK78 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pcgf5Q3UK78 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pcgf5Q3UK78 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pcgf5Q3UK78 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pcgf5Q3UK78 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pcgf5Q3UK78 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Pcgf5Q3UK78 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pcgf5Q3UK78 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pcgf5Q3UK78 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pcgf5Q3UK78 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pcgf5Q3UK78 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pcgf5Q3UK78 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pcgf5Q3UK78 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pcgf5Q3UK78 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pcgf5Q3UK78 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pcgf5Q3UK78 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pcgf5Q3UK78 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Pcgf5Q3UK78 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
Pcgf5Q3UK78 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pcgf5Q3UK78 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pcgf5Q3UK78 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pcgf5Q3UK78 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pcgf5Q3UK78 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pcgf5Q3UK78 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pcgf5Q3UK78 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pcgf5Q3UK78 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pcgf5Q3UK78 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pcgf5Q3UK78 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pcgf5Q3UK78 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Pcgf5Q3UK78 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pcgf5Q3UK78 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pcgf5Q3UK78 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pcgf5Q3UK78 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Pcgf5Q3UK78 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Pcgf5Q3UK78 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pcgf5Q3UK78 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pcgf5Q3UK78 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pcgf5Q3UK78 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pcgf5Q3UK78 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pcgf5Q3UK78 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pcgf5Q3UK78 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pcgf5Q3UK78 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pcgf5Q3UK78 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pcgf5Q3UK78 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pcgf5Q3UK78 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pcgf5Q3UK78 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pcgf5Q3UK78 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pcgf5Q3UK78 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pcgf5Q3UK78 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pcgf5Q3UK78 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pcgf5Q3UK78 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pcgf5Q3UK78 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pcgf5Q3UK78 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pcgf5Q3UK78 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pcgf5Q3UK78 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pcgf5Q3UK78 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pcgf5Q3UK78 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pcgf5Q3UK78 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pcgf5Q3UK78 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pcgf5Q3UK78 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pcgf5Q3UK78 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pcgf5Q3UK78 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pcgf5Q3UK78 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pcgf5Q3UK78 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pcgf5Q3UK78 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pcgf5Q3UK78 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pcgf5Q3UK78 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pcgf5Q3UK78 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pcgf5Q3UK78 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pcgf5Q3UK78 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pcgf5Q3UK78 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pcgf5Q3UK78 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pcgf5Q3UK78 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pcgf5Q3UK78 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pcgf5Q3UK78 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pcgf5Q3UK78 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pcgf5Q3UK78 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pcgf5Q3UK78 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pcgf5Q3UK78 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pcgf5Q3UK78 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pcgf5Q3UK78 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pcgf5Q3UK78 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pcgf5Q3UK78 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pcgf5Q3UK78 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pcgf5Q3UK78 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pcgf5Q3UK78 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pcgf5Q3UK78 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pcgf5Q3UK78 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pcgf5Q3UK78 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pcgf5Q3UK78 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pcgf5Q3UK78 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pcgf5Q3UK78 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pcgf5Q3UK78 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms