Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJV1

Ccdc61, Coiled-coil domain-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc61Q3UJV1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc61Q3UJV1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc61Q3UJV1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc61Q3UJV1 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc61Q3UJV1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc61Q3UJV1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc61Q3UJV1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc61Q3UJV1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc61Q3UJV1 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc61Q3UJV1 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc61Q3UJV1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc61Q3UJV1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc61Q3UJV1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc61Q3UJV1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc61Q3UJV1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc61Q3UJV1 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc61Q3UJV1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc61Q3UJV1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc61Q3UJV1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc61Q3UJV1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc61Q3UJV1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc61Q3UJV1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc61Q3UJV1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc61Q3UJV1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc61Q3UJV1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc61Q3UJV1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc61Q3UJV1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc61Q3UJV1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc61Q3UJV1 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc61Q3UJV1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc61Q3UJV1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc61Q3UJV1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc61Q3UJV1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc61Q3UJV1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc61Q3UJV1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc61Q3UJV1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc61Q3UJV1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc61Q3UJV1 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc61Q3UJV1 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc61Q3UJV1 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc61Q3UJV1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc61Q3UJV1 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc61Q3UJV1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc61Q3UJV1 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc61Q3UJV1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc61Q3UJV1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc61Q3UJV1 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc61Q3UJV1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc61Q3UJV1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc61Q3UJV1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc61Q3UJV1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc61Q3UJV1 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc61Q3UJV1 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc61Q3UJV1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc61Q3UJV1 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc61Q3UJV1 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc61Q3UJV1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc61Q3UJV1 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc61Q3UJV1 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc61Q3UJV1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc61Q3UJV1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc61Q3UJV1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc61Q3UJV1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc61Q3UJV1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc61Q3UJV1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc61Q3UJV1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc61Q3UJV1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc61Q3UJV1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc61Q3UJV1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc61Q3UJV1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc61Q3UJV1 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc61Q3UJV1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc61Q3UJV1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc61Q3UJV1 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc61Q3UJV1 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc61Q3UJV1 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc61Q3UJV1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc61Q3UJV1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc61Q3UJV1 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc61Q3UJV1 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc61Q3UJV1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc61Q3UJV1 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc61Q3UJV1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc61Q3UJV1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc61Q3UJV1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc61Q3UJV1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc61Q3UJV1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc61Q3UJV1 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc61Q3UJV1 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc61Q3UJV1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc61Q3UJV1 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc61Q3UJV1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc61Q3UJV1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc61Q3UJV1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc61Q3UJV1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc61Q3UJV1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc61Q3UJV1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc61Q3UJV1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc61Q3UJV1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc61Q3UJV1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms