Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp19Q3UJD6 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp19Q3UJD6 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp19Q3UJD6 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp19Q3UJD6 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp19Q3UJD6 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp19Q3UJD6 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp19Q3UJD6 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp19Q3UJD6 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp19Q3UJD6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp19Q3UJD6 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp19Q3UJD6 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp19Q3UJD6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp19Q3UJD6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp19Q3UJD6 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp19Q3UJD6 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp19Q3UJD6 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp19Q3UJD6 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp19Q3UJD6 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp19Q3UJD6 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp19Q3UJD6 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp19Q3UJD6 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp19Q3UJD6 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp19Q3UJD6 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp19Q3UJD6 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp19Q3UJD6 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp19Q3UJD6 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp19Q3UJD6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp19Q3UJD6 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp19Q3UJD6 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp19Q3UJD6 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp19Q3UJD6 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp19Q3UJD6 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp19Q3UJD6 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp19Q3UJD6 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp19Q3UJD6 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp19Q3UJD6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp19Q3UJD6 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp19Q3UJD6 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp19Q3UJD6 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp19Q3UJD6 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp19Q3UJD6 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp19Q3UJD6 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp19Q3UJD6 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp19Q3UJD6 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp19Q3UJD6 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp19Q3UJD6 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp19Q3UJD6 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp19Q3UJD6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp19Q3UJD6 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp19Q3UJD6 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Usp19Q3UJD6 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Usp19Q3UJD6 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
Usp19Q3UJD6 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp19Q3UJD6 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp19Q3UJD6 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp19Q3UJD6 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp19Q3UJD6 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp19Q3UJD6 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp19Q3UJD6 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp19Q3UJD6 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp19Q3UJD6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp19Q3UJD6 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp19Q3UJD6 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp19Q3UJD6 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp19Q3UJD6 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp19Q3UJD6 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp19Q3UJD6 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp19Q3UJD6 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp19Q3UJD6 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp19Q3UJD6 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp19Q3UJD6 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp19Q3UJD6 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp19Q3UJD6 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp19Q3UJD6 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp19Q3UJD6 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp19Q3UJD6 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp19Q3UJD6 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp19Q3UJD6 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp19Q3UJD6 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp19Q3UJD6 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp19Q3UJD6 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp19Q3UJD6 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp19Q3UJD6 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp19Q3UJD6 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp19Q3UJD6 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp19Q3UJD6 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp19Q3UJD6 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp19Q3UJD6 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp19Q3UJD6 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp19Q3UJD6 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp19Q3UJD6 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp19Q3UJD6 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp19Q3UJD6 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp19Q3UJD6 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp19Q3UJD6 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp19Q3UJD6 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp19Q3UJD6 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp19Q3UJD6 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp19Q3UJD6 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms