Protein–RNA interactions for Protein: Q3UBG2

Pid1, PTB-containing, cubilin and LRP1-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pid1Q3UBG2 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pid1Q3UBG2 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pid1Q3UBG2 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pid1Q3UBG2 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pid1Q3UBG2 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pid1Q3UBG2 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pid1Q3UBG2 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pid1Q3UBG2 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pid1Q3UBG2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pid1Q3UBG2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pid1Q3UBG2 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pid1Q3UBG2 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pid1Q3UBG2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pid1Q3UBG2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pid1Q3UBG2 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pid1Q3UBG2 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pid1Q3UBG2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pid1Q3UBG2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pid1Q3UBG2 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pid1Q3UBG2 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pid1Q3UBG2 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pid1Q3UBG2 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pid1Q3UBG2 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pid1Q3UBG2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pid1Q3UBG2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pid1Q3UBG2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pid1Q3UBG2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pid1Q3UBG2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pid1Q3UBG2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pid1Q3UBG2 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pid1Q3UBG2 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pid1Q3UBG2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pid1Q3UBG2 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pid1Q3UBG2 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pid1Q3UBG2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pid1Q3UBG2 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pid1Q3UBG2 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pid1Q3UBG2 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pid1Q3UBG2 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pid1Q3UBG2 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pid1Q3UBG2 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pid1Q3UBG2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pid1Q3UBG2 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pid1Q3UBG2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pid1Q3UBG2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pid1Q3UBG2 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Pid1Q3UBG2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Pid1Q3UBG2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pid1Q3UBG2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pid1Q3UBG2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pid1Q3UBG2 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pid1Q3UBG2 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pid1Q3UBG2 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pid1Q3UBG2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pid1Q3UBG2 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pid1Q3UBG2 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pid1Q3UBG2 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pid1Q3UBG2 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pid1Q3UBG2 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pid1Q3UBG2 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pid1Q3UBG2 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pid1Q3UBG2 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pid1Q3UBG2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pid1Q3UBG2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pid1Q3UBG2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pid1Q3UBG2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pid1Q3UBG2 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pid1Q3UBG2 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pid1Q3UBG2 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pid1Q3UBG2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pid1Q3UBG2 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pid1Q3UBG2 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pid1Q3UBG2 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pid1Q3UBG2 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pid1Q3UBG2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pid1Q3UBG2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pid1Q3UBG2 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pid1Q3UBG2 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pid1Q3UBG2 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pid1Q3UBG2 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pid1Q3UBG2 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pid1Q3UBG2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pid1Q3UBG2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pid1Q3UBG2 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pid1Q3UBG2 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pid1Q3UBG2 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pid1Q3UBG2 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pid1Q3UBG2 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pid1Q3UBG2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pid1Q3UBG2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pid1Q3UBG2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pid1Q3UBG2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pid1Q3UBG2 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pid1Q3UBG2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pid1Q3UBG2 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pid1Q3UBG2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pid1Q3UBG2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pid1Q3UBG2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pid1Q3UBG2 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pid1Q3UBG2 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms