Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
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Rnf180Q3U827 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
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Rnf180Q3U827 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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Rnf180Q3U827 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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Rnf180Q3U827 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnf180Q3U827 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnf180Q3U827 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
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