Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3C9

Gse1, Genetic suppressor element 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gse1Q3U3C9 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Gse1Q3U3C9 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Gse1Q3U3C9 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gse1Q3U3C9 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Gse1Q3U3C9 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gse1Q3U3C9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gse1Q3U3C9 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gse1Q3U3C9 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gse1Q3U3C9 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gse1Q3U3C9 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gse1Q3U3C9 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gse1Q3U3C9 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gse1Q3U3C9 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gse1Q3U3C9 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gse1Q3U3C9 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gse1Q3U3C9 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gse1Q3U3C9 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gse1Q3U3C9 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gse1Q3U3C9 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gse1Q3U3C9 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gse1Q3U3C9 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gse1Q3U3C9 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Gse1Q3U3C9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gse1Q3U3C9 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gse1Q3U3C9 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gse1Q3U3C9 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gse1Q3U3C9 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gse1Q3U3C9 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gse1Q3U3C9 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gse1Q3U3C9 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gse1Q3U3C9 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gse1Q3U3C9 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gse1Q3U3C9 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gse1Q3U3C9 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gse1Q3U3C9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gse1Q3U3C9 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gse1Q3U3C9 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gse1Q3U3C9 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gse1Q3U3C9 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gse1Q3U3C9 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gse1Q3U3C9 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gse1Q3U3C9 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gse1Q3U3C9 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gse1Q3U3C9 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gse1Q3U3C9 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gse1Q3U3C9 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gse1Q3U3C9 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gse1Q3U3C9 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gse1Q3U3C9 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gse1Q3U3C9 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gse1Q3U3C9 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gse1Q3U3C9 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gse1Q3U3C9 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gse1Q3U3C9 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gse1Q3U3C9 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gse1Q3U3C9 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gse1Q3U3C9 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gse1Q3U3C9 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gse1Q3U3C9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gse1Q3U3C9 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gse1Q3U3C9 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gse1Q3U3C9 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gse1Q3U3C9 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gse1Q3U3C9 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gse1Q3U3C9 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gse1Q3U3C9 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gse1Q3U3C9 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gse1Q3U3C9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gse1Q3U3C9 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gse1Q3U3C9 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gse1Q3U3C9 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gse1Q3U3C9 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gse1Q3U3C9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gse1Q3U3C9 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gse1Q3U3C9 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gse1Q3U3C9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gse1Q3U3C9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gse1Q3U3C9 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gse1Q3U3C9 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gse1Q3U3C9 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gse1Q3U3C9 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gse1Q3U3C9 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gse1Q3U3C9 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gse1Q3U3C9 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gse1Q3U3C9 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gse1Q3U3C9 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gse1Q3U3C9 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gse1Q3U3C9 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Gse1Q3U3C9 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gse1Q3U3C9 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gse1Q3U3C9 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gse1Q3U3C9 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gse1Q3U3C9 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gse1Q3U3C9 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gse1Q3U3C9 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gse1Q3U3C9 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gse1Q3U3C9 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gse1Q3U3C9 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gse1Q3U3C9 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gse1Q3U3C9 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms