Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rnf40Q3U319 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnf40Q3U319 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnf40Q3U319 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnf40Q3U319 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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Rnf40Q3U319 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
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Rnf40Q3U319 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rnf40Q3U319 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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Rnf40Q3U319 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Rnf40Q3U319 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf40Q3U319 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf40Q3U319 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Rnf40Q3U319 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Rnf40Q3U319 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Rnf40Q3U319 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf40Q3U319 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms