Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX2

Lrrn4cl, LRRN4 C-terminal-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn4clQ3TYX2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrn4clQ3TYX2 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrn4clQ3TYX2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrn4clQ3TYX2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrn4clQ3TYX2 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrn4clQ3TYX2 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrn4clQ3TYX2 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrn4clQ3TYX2 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrn4clQ3TYX2 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrn4clQ3TYX2 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrn4clQ3TYX2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrn4clQ3TYX2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrn4clQ3TYX2 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrn4clQ3TYX2 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Lrrn4clQ3TYX2 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrn4clQ3TYX2 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrn4clQ3TYX2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrn4clQ3TYX2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrn4clQ3TYX2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrn4clQ3TYX2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrn4clQ3TYX2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrn4clQ3TYX2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrn4clQ3TYX2 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrn4clQ3TYX2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrn4clQ3TYX2 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrn4clQ3TYX2 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrn4clQ3TYX2 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrn4clQ3TYX2 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrn4clQ3TYX2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrn4clQ3TYX2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrn4clQ3TYX2 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrn4clQ3TYX2 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrn4clQ3TYX2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrn4clQ3TYX2 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrn4clQ3TYX2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrn4clQ3TYX2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrn4clQ3TYX2 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrn4clQ3TYX2 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrn4clQ3TYX2 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrn4clQ3TYX2 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrn4clQ3TYX2 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrn4clQ3TYX2 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrn4clQ3TYX2 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrn4clQ3TYX2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrn4clQ3TYX2 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrn4clQ3TYX2 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrn4clQ3TYX2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrn4clQ3TYX2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrn4clQ3TYX2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrn4clQ3TYX2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrn4clQ3TYX2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrn4clQ3TYX2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrn4clQ3TYX2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrn4clQ3TYX2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrn4clQ3TYX2 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrn4clQ3TYX2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrn4clQ3TYX2 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrn4clQ3TYX2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrn4clQ3TYX2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrn4clQ3TYX2 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrn4clQ3TYX2 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrrn4clQ3TYX2 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrrn4clQ3TYX2 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrrn4clQ3TYX2 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrrn4clQ3TYX2 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrrn4clQ3TYX2 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrrn4clQ3TYX2 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrrn4clQ3TYX2 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrrn4clQ3TYX2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrrn4clQ3TYX2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrrn4clQ3TYX2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrrn4clQ3TYX2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrrn4clQ3TYX2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrrn4clQ3TYX2 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrrn4clQ3TYX2 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrrn4clQ3TYX2 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrrn4clQ3TYX2 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrrn4clQ3TYX2 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrrn4clQ3TYX2 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrrn4clQ3TYX2 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrrn4clQ3TYX2 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrrn4clQ3TYX2 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrrn4clQ3TYX2 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrrn4clQ3TYX2 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrrn4clQ3TYX2 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrrn4clQ3TYX2 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrrn4clQ3TYX2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrrn4clQ3TYX2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrrn4clQ3TYX2 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrrn4clQ3TYX2 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrrn4clQ3TYX2 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrrn4clQ3TYX2 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrrn4clQ3TYX2 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrrn4clQ3TYX2 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrrn4clQ3TYX2 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrrn4clQ3TYX2 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrrn4clQ3TYX2 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrrn4clQ3TYX2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrrn4clQ3TYX2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrrn4clQ3TYX2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms