Protein–RNA interactions for Protein: Q3TY92

Mbd6, Methyl-CpG-binding domain protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd6Q3TY92 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mbd6Q3TY92 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mbd6Q3TY92 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mbd6Q3TY92 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mbd6Q3TY92 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mbd6Q3TY92 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd6Q3TY92 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd6Q3TY92 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd6Q3TY92 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd6Q3TY92 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd6Q3TY92 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd6Q3TY92 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd6Q3TY92 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd6Q3TY92 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd6Q3TY92 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd6Q3TY92 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd6Q3TY92 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd6Q3TY92 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd6Q3TY92 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd6Q3TY92 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd6Q3TY92 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd6Q3TY92 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd6Q3TY92 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd6Q3TY92 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd6Q3TY92 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd6Q3TY92 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd6Q3TY92 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd6Q3TY92 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd6Q3TY92 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd6Q3TY92 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd6Q3TY92 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd6Q3TY92 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd6Q3TY92 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd6Q3TY92 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd6Q3TY92 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd6Q3TY92 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd6Q3TY92 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd6Q3TY92 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd6Q3TY92 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd6Q3TY92 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd6Q3TY92 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd6Q3TY92 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd6Q3TY92 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd6Q3TY92 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd6Q3TY92 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd6Q3TY92 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mbd6Q3TY92 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mbd6Q3TY92 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Mbd6Q3TY92 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mbd6Q3TY92 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mbd6Q3TY92 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mbd6Q3TY92 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mbd6Q3TY92 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mbd6Q3TY92 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mbd6Q3TY92 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mbd6Q3TY92 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mbd6Q3TY92 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mbd6Q3TY92 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mbd6Q3TY92 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mbd6Q3TY92 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mbd6Q3TY92 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mbd6Q3TY92 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mbd6Q3TY92 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mbd6Q3TY92 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mbd6Q3TY92 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd6Q3TY92 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd6Q3TY92 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd6Q3TY92 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd6Q3TY92 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd6Q3TY92 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd6Q3TY92 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd6Q3TY92 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd6Q3TY92 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd6Q3TY92 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd6Q3TY92 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd6Q3TY92 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd6Q3TY92 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd6Q3TY92 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd6Q3TY92 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd6Q3TY92 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd6Q3TY92 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd6Q3TY92 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd6Q3TY92 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd6Q3TY92 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd6Q3TY92 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd6Q3TY92 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mbd6Q3TY92 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mbd6Q3TY92 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mbd6Q3TY92 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mbd6Q3TY92 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mbd6Q3TY92 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mbd6Q3TY92 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Mbd6Q3TY92 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mbd6Q3TY92 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mbd6Q3TY92 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mbd6Q3TY92 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mbd6Q3TY92 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mbd6Q3TY92 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mbd6Q3TY92 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mbd6Q3TY92 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms