Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtf3c3Q3TMP1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtf3c3Q3TMP1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtf3c3Q3TMP1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtf3c3Q3TMP1 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtf3c3Q3TMP1 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtf3c3Q3TMP1 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtf3c3Q3TMP1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtf3c3Q3TMP1 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtf3c3Q3TMP1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtf3c3Q3TMP1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtf3c3Q3TMP1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtf3c3Q3TMP1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtf3c3Q3TMP1 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtf3c3Q3TMP1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtf3c3Q3TMP1 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtf3c3Q3TMP1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtf3c3Q3TMP1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtf3c3Q3TMP1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtf3c3Q3TMP1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtf3c3Q3TMP1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtf3c3Q3TMP1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtf3c3Q3TMP1 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtf3c3Q3TMP1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf3c3Q3TMP1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf3c3Q3TMP1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf3c3Q3TMP1 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf3c3Q3TMP1 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf3c3Q3TMP1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf3c3Q3TMP1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf3c3Q3TMP1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf3c3Q3TMP1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf3c3Q3TMP1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf3c3Q3TMP1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf3c3Q3TMP1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf3c3Q3TMP1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf3c3Q3TMP1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf3c3Q3TMP1 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf3c3Q3TMP1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf3c3Q3TMP1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf3c3Q3TMP1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf3c3Q3TMP1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf3c3Q3TMP1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf3c3Q3TMP1 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gtf3c3Q3TMP1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gtf3c3Q3TMP1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Gtf3c3Q3TMP1 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gtf3c3Q3TMP1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gtf3c3Q3TMP1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gtf3c3Q3TMP1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gtf3c3Q3TMP1 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gtf3c3Q3TMP1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gtf3c3Q3TMP1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gtf3c3Q3TMP1 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gtf3c3Q3TMP1 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtf3c3Q3TMP1 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtf3c3Q3TMP1 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtf3c3Q3TMP1 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtf3c3Q3TMP1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtf3c3Q3TMP1 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtf3c3Q3TMP1 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtf3c3Q3TMP1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gtf3c3Q3TMP1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gtf3c3Q3TMP1 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gtf3c3Q3TMP1 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gtf3c3Q3TMP1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Gtf3c3Q3TMP1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gtf3c3Q3TMP1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gtf3c3Q3TMP1 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gtf3c3Q3TMP1 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gtf3c3Q3TMP1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gtf3c3Q3TMP1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gtf3c3Q3TMP1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gtf3c3Q3TMP1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf3c3Q3TMP1 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf3c3Q3TMP1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf3c3Q3TMP1 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf3c3Q3TMP1 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf3c3Q3TMP1 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf3c3Q3TMP1 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf3c3Q3TMP1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf3c3Q3TMP1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf3c3Q3TMP1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf3c3Q3TMP1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf3c3Q3TMP1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf3c3Q3TMP1 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf3c3Q3TMP1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf3c3Q3TMP1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf3c3Q3TMP1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf3c3Q3TMP1 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf3c3Q3TMP1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf3c3Q3TMP1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf3c3Q3TMP1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf3c3Q3TMP1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf3c3Q3TMP1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf3c3Q3TMP1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf3c3Q3TMP1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70 ms