Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cpne9Q1RLL3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cpne9Q1RLL3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cpne9Q1RLL3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cpne9Q1RLL3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cpne9Q1RLL3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cpne9Q1RLL3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cpne9Q1RLL3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Cpne9Q1RLL3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cpne9Q1RLL3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cpne9Q1RLL3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cpne9Q1RLL3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cpne9Q1RLL3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cpne9Q1RLL3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cpne9Q1RLL3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cpne9Q1RLL3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Cpne9Q1RLL3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Cpne9Q1RLL3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cpne9Q1RLL3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Cpne9Q1RLL3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cpne9Q1RLL3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cpne9Q1RLL3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cpne9Q1RLL3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cpne9Q1RLL3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cpne9Q1RLL3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cpne9Q1RLL3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cpne9Q1RLL3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cpne9Q1RLL3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cpne9Q1RLL3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cpne9Q1RLL3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cpne9Q1RLL3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cpne9Q1RLL3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cpne9Q1RLL3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Cpne9Q1RLL3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Cpne9Q1RLL3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cpne9Q1RLL3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Cpne9Q1RLL3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cpne9Q1RLL3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cpne9Q1RLL3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cpne9Q1RLL3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cpne9Q1RLL3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cpne9Q1RLL3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cpne9Q1RLL3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cpne9Q1RLL3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cpne9Q1RLL3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cpne9Q1RLL3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cpne9Q1RLL3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cpne9Q1RLL3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cpne9Q1RLL3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cpne9Q1RLL3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cpne9Q1RLL3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cpne9Q1RLL3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cpne9Q1RLL3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cpne9Q1RLL3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cpne9Q1RLL3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cpne9Q1RLL3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cpne9Q1RLL3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cpne9Q1RLL3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cpne9Q1RLL3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cpne9Q1RLL3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cpne9Q1RLL3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cpne9Q1RLL3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Cpne9Q1RLL3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
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Cpne9Q1RLL3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cpne9Q1RLL3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cpne9Q1RLL3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cpne9Q1RLL3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cpne9Q1RLL3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cpne9Q1RLL3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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Cpne9Q1RLL3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cpne9Q1RLL3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cpne9Q1RLL3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cpne9Q1RLL3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cpne9Q1RLL3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Cpne9Q1RLL3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cpne9Q1RLL3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cpne9Q1RLL3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cpne9Q1RLL3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cpne9Q1RLL3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cpne9Q1RLL3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cpne9Q1RLL3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cpne9Q1RLL3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cpne9Q1RLL3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cpne9Q1RLL3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cpne9Q1RLL3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cpne9Q1RLL3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cpne9Q1RLL3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cpne9Q1RLL3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Cpne9Q1RLL3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cpne9Q1RLL3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cpne9Q1RLL3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cpne9Q1RLL3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cpne9Q1RLL3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Cpne9Q1RLL3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cpne9Q1RLL3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Cpne9Q1RLL3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cpne9Q1RLL3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cpne9Q1RLL3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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