Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trim71Q1PSW8 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trim71Q1PSW8 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trim71Q1PSW8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trim71Q1PSW8 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trim71Q1PSW8 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trim71Q1PSW8 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trim71Q1PSW8 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trim71Q1PSW8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trim71Q1PSW8 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Trim71Q1PSW8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trim71Q1PSW8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim71Q1PSW8 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim71Q1PSW8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim71Q1PSW8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim71Q1PSW8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim71Q1PSW8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim71Q1PSW8 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim71Q1PSW8 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim71Q1PSW8 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim71Q1PSW8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim71Q1PSW8 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim71Q1PSW8 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim71Q1PSW8 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim71Q1PSW8 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim71Q1PSW8 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim71Q1PSW8 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim71Q1PSW8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim71Q1PSW8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim71Q1PSW8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim71Q1PSW8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim71Q1PSW8 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim71Q1PSW8 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim71Q1PSW8 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim71Q1PSW8 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim71Q1PSW8 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim71Q1PSW8 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim71Q1PSW8 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim71Q1PSW8 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim71Q1PSW8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim71Q1PSW8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim71Q1PSW8 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim71Q1PSW8 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim71Q1PSW8 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim71Q1PSW8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim71Q1PSW8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim71Q1PSW8 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim71Q1PSW8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim71Q1PSW8 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim71Q1PSW8 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim71Q1PSW8 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim71Q1PSW8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim71Q1PSW8 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim71Q1PSW8 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim71Q1PSW8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim71Q1PSW8 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim71Q1PSW8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim71Q1PSW8 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim71Q1PSW8 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim71Q1PSW8 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim71Q1PSW8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim71Q1PSW8 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim71Q1PSW8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim71Q1PSW8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim71Q1PSW8 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim71Q1PSW8 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim71Q1PSW8 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim71Q1PSW8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim71Q1PSW8 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim71Q1PSW8 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim71Q1PSW8 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim71Q1PSW8 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim71Q1PSW8 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim71Q1PSW8 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim71Q1PSW8 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim71Q1PSW8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim71Q1PSW8 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim71Q1PSW8 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim71Q1PSW8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim71Q1PSW8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim71Q1PSW8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim71Q1PSW8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim71Q1PSW8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim71Q1PSW8 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim71Q1PSW8 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim71Q1PSW8 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim71Q1PSW8 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim71Q1PSW8 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim71Q1PSW8 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim71Q1PSW8 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim71Q1PSW8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim71Q1PSW8 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim71Q1PSW8 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim71Q1PSW8 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim71Q1PSW8 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim71Q1PSW8 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim71Q1PSW8 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim71Q1PSW8 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim71Q1PSW8 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Trim71Q1PSW8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms