Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rpusd2Q149F1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rpusd2Q149F1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Rpusd2Q149F1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rpusd2Q149F1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rpusd2Q149F1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rpusd2Q149F1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rpusd2Q149F1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rpusd2Q149F1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rpusd2Q149F1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rpusd2Q149F1 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Rpusd2Q149F1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rpusd2Q149F1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rpusd2Q149F1 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rpusd2Q149F1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rpusd2Q149F1 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rpusd2Q149F1 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rpusd2Q149F1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rpusd2Q149F1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rpusd2Q149F1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rpusd2Q149F1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rpusd2Q149F1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rpusd2Q149F1 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rpusd2Q149F1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rpusd2Q149F1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rpusd2Q149F1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rpusd2Q149F1 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rpusd2Q149F1 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Rpusd2Q149F1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rpusd2Q149F1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rpusd2Q149F1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rpusd2Q149F1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rpusd2Q149F1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rpusd2Q149F1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rpusd2Q149F1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rpusd2Q149F1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rpusd2Q149F1 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rpusd2Q149F1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rpusd2Q149F1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rpusd2Q149F1 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rpusd2Q149F1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rpusd2Q149F1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rpusd2Q149F1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rpusd2Q149F1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rpusd2Q149F1 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rpusd2Q149F1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rpusd2Q149F1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rpusd2Q149F1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rpusd2Q149F1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rpusd2Q149F1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rpusd2Q149F1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Rpusd2Q149F1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rpusd2Q149F1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rpusd2Q149F1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rpusd2Q149F1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rpusd2Q149F1 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rpusd2Q149F1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rpusd2Q149F1 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rpusd2Q149F1 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rpusd2Q149F1 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Rpusd2Q149F1 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Rpusd2Q149F1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rpusd2Q149F1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rpusd2Q149F1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rpusd2Q149F1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rpusd2Q149F1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rpusd2Q149F1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rpusd2Q149F1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rpusd2Q149F1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rpusd2Q149F1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rpusd2Q149F1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rpusd2Q149F1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rpusd2Q149F1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rpusd2Q149F1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rpusd2Q149F1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rpusd2Q149F1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rpusd2Q149F1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rpusd2Q149F1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rpusd2Q149F1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rpusd2Q149F1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rpusd2Q149F1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rpusd2Q149F1 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rpusd2Q149F1 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rpusd2Q149F1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rpusd2Q149F1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rpusd2Q149F1 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Rpusd2Q149F1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rpusd2Q149F1 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rpusd2Q149F1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Rpusd2Q149F1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rpusd2Q149F1 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rpusd2Q149F1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rpusd2Q149F1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rpusd2Q149F1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rpusd2Q149F1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rpusd2Q149F1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rpusd2Q149F1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rpusd2Q149F1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rpusd2Q149F1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rpusd2Q149F1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms