Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Traf3ip1Q149C2 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Traf3ip1Q149C2 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Traf3ip1Q149C2 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Traf3ip1Q149C2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Traf3ip1Q149C2 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Traf3ip1Q149C2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Traf3ip1Q149C2 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Traf3ip1Q149C2 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Traf3ip1Q149C2 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Traf3ip1Q149C2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Traf3ip1Q149C2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Traf3ip1Q149C2 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Traf3ip1Q149C2 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Traf3ip1Q149C2 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Traf3ip1Q149C2 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Traf3ip1Q149C2 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Traf3ip1Q149C2 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Traf3ip1Q149C2 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Traf3ip1Q149C2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Traf3ip1Q149C2 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Traf3ip1Q149C2 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Traf3ip1Q149C2 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Traf3ip1Q149C2 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Traf3ip1Q149C2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Traf3ip1Q149C2 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Traf3ip1Q149C2 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Traf3ip1Q149C2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Traf3ip1Q149C2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Traf3ip1Q149C2 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Traf3ip1Q149C2 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Traf3ip1Q149C2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Traf3ip1Q149C2 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Traf3ip1Q149C2 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Traf3ip1Q149C2 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Traf3ip1Q149C2 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Traf3ip1Q149C2 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Traf3ip1Q149C2 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Traf3ip1Q149C2 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Traf3ip1Q149C2 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Traf3ip1Q149C2 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Traf3ip1Q149C2 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Traf3ip1Q149C2 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Traf3ip1Q149C2 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Traf3ip1Q149C2 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Traf3ip1Q149C2 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Traf3ip1Q149C2 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Traf3ip1Q149C2 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Traf3ip1Q149C2 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Traf3ip1Q149C2 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Traf3ip1Q149C2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Traf3ip1Q149C2 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Traf3ip1Q149C2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Traf3ip1Q149C2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Traf3ip1Q149C2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Traf3ip1Q149C2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Traf3ip1Q149C2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Traf3ip1Q149C2 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Traf3ip1Q149C2 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Traf3ip1Q149C2 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Traf3ip1Q149C2 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Traf3ip1Q149C2 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Traf3ip1Q149C2 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Traf3ip1Q149C2 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
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Traf3ip1Q149C2 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Traf3ip1Q149C2 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Traf3ip1Q149C2 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Traf3ip1Q149C2 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Traf3ip1Q149C2 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Traf3ip1Q149C2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Traf3ip1Q149C2 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Traf3ip1Q149C2 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Traf3ip1Q149C2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Traf3ip1Q149C2 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Traf3ip1Q149C2 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Traf3ip1Q149C2 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Traf3ip1Q149C2 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Traf3ip1Q149C2 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Traf3ip1Q149C2 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Traf3ip1Q149C2 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Traf3ip1Q149C2 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Traf3ip1Q149C2 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Traf3ip1Q149C2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Traf3ip1Q149C2 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Traf3ip1Q149C2 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Traf3ip1Q149C2 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Traf3ip1Q149C2 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Traf3ip1Q149C2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Traf3ip1Q149C2 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Traf3ip1Q149C2 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Traf3ip1Q149C2 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Traf3ip1Q149C2 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Traf3ip1Q149C2 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Traf3ip1Q149C2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Traf3ip1Q149C2 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Traf3ip1Q149C2 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Traf3ip1Q149C2 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Traf3ip1Q149C2 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Traf3ip1Q149C2 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms