Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb8Q0VBD0 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Itgb8Q0VBD0 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Itgb8Q0VBD0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Itgb8Q0VBD0 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Itgb8Q0VBD0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Itgb8Q0VBD0 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Itgb8Q0VBD0 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb8Q0VBD0 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb8Q0VBD0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb8Q0VBD0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb8Q0VBD0 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb8Q0VBD0 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb8Q0VBD0 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb8Q0VBD0 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb8Q0VBD0 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb8Q0VBD0 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb8Q0VBD0 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb8Q0VBD0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb8Q0VBD0 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb8Q0VBD0 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb8Q0VBD0 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb8Q0VBD0 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb8Q0VBD0 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb8Q0VBD0 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb8Q0VBD0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb8Q0VBD0 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb8Q0VBD0 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb8Q0VBD0 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb8Q0VBD0 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb8Q0VBD0 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb8Q0VBD0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb8Q0VBD0 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb8Q0VBD0 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb8Q0VBD0 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb8Q0VBD0 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb8Q0VBD0 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb8Q0VBD0 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb8Q0VBD0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb8Q0VBD0 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb8Q0VBD0 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb8Q0VBD0 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb8Q0VBD0 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb8Q0VBD0 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb8Q0VBD0 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb8Q0VBD0 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb8Q0VBD0 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb8Q0VBD0 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb8Q0VBD0 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb8Q0VBD0 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb8Q0VBD0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb8Q0VBD0 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb8Q0VBD0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb8Q0VBD0 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb8Q0VBD0 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb8Q0VBD0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb8Q0VBD0 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb8Q0VBD0 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb8Q0VBD0 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb8Q0VBD0 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb8Q0VBD0 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb8Q0VBD0 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb8Q0VBD0 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb8Q0VBD0 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb8Q0VBD0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb8Q0VBD0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms