Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Vps8Q0P5W1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Vps8Q0P5W1 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Vps8Q0P5W1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Vps8Q0P5W1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Vps8Q0P5W1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Vps8Q0P5W1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Vps8Q0P5W1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Vps8Q0P5W1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Vps8Q0P5W1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Vps8Q0P5W1 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Vps8Q0P5W1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Vps8Q0P5W1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Vps8Q0P5W1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Vps8Q0P5W1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Vps8Q0P5W1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.8
Vps8Q0P5W1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.8
Vps8Q0P5W1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.8
Vps8Q0P5W1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.8
Vps8Q0P5W1 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Vps8Q0P5W1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Vps8Q0P5W1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Vps8Q0P5W1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Vps8Q0P5W1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Vps8Q0P5W1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Vps8Q0P5W1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Vps8Q0P5W1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Vps8Q0P5W1 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Vps8Q0P5W1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Vps8Q0P5W1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Vps8Q0P5W1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Vps8Q0P5W1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Vps8Q0P5W1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Vps8Q0P5W1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Vps8Q0P5W1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Vps8Q0P5W1 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Vps8Q0P5W1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Vps8Q0P5W1 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Vps8Q0P5W1 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Vps8Q0P5W1 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Vps8Q0P5W1 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Vps8Q0P5W1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Vps8Q0P5W1 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Vps8Q0P5W1 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Vps8Q0P5W1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Vps8Q0P5W1 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Vps8Q0P5W1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Vps8Q0P5W1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Vps8Q0P5W1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Vps8Q0P5W1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Vps8Q0P5W1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Vps8Q0P5W1 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Vps8Q0P5W1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Vps8Q0P5W1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Vps8Q0P5W1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Vps8Q0P5W1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Vps8Q0P5W1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Vps8Q0P5W1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Vps8Q0P5W1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Vps8Q0P5W1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Vps8Q0P5W1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Vps8Q0P5W1 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Vps8Q0P5W1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Vps8Q0P5W1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Vps8Q0P5W1 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Vps8Q0P5W1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Vps8Q0P5W1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Vps8Q0P5W1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Vps8Q0P5W1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Vps8Q0P5W1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Vps8Q0P5W1 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Vps8Q0P5W1 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Vps8Q0P5W1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Vps8Q0P5W1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Vps8Q0P5W1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Vps8Q0P5W1 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Vps8Q0P5W1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Vps8Q0P5W1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Vps8Q0P5W1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Vps8Q0P5W1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Vps8Q0P5W1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Vps8Q0P5W1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Vps8Q0P5W1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Vps8Q0P5W1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Vps8Q0P5W1 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
Vps8Q0P5W1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Vps8Q0P5W1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Vps8Q0P5W1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Vps8Q0P5W1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Vps8Q0P5W1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Vps8Q0P5W1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Vps8Q0P5W1 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Vps8Q0P5W1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Vps8Q0P5W1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Vps8Q0P5W1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Vps8Q0P5W1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Vps8Q0P5W1 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Vps8Q0P5W1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Vps8Q0P5W1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Vps8Q0P5W1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 195.2 ms