Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cass4Q08EC4 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cass4Q08EC4 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cass4Q08EC4 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cass4Q08EC4 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cass4Q08EC4 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cass4Q08EC4 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cass4Q08EC4 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cass4Q08EC4 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cass4Q08EC4 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cass4Q08EC4 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cass4Q08EC4 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cass4Q08EC4 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cass4Q08EC4 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cass4Q08EC4 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cass4Q08EC4 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cass4Q08EC4 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cass4Q08EC4 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cass4Q08EC4 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cass4Q08EC4 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cass4Q08EC4 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cass4Q08EC4 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cass4Q08EC4 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cass4Q08EC4 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cass4Q08EC4 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cass4Q08EC4 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cass4Q08EC4 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cass4Q08EC4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cass4Q08EC4 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cass4Q08EC4 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cass4Q08EC4 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cass4Q08EC4 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cass4Q08EC4 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cass4Q08EC4 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cass4Q08EC4 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cass4Q08EC4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cass4Q08EC4 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cass4Q08EC4 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cass4Q08EC4 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cass4Q08EC4 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cass4Q08EC4 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cass4Q08EC4 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cass4Q08EC4 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cass4Q08EC4 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cass4Q08EC4 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cass4Q08EC4 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cass4Q08EC4 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cass4Q08EC4 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cass4Q08EC4 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cass4Q08EC4 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cass4Q08EC4 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cass4Q08EC4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cass4Q08EC4 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cass4Q08EC4 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cass4Q08EC4 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cass4Q08EC4 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cass4Q08EC4 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cass4Q08EC4 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cass4Q08EC4 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cass4Q08EC4 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cass4Q08EC4 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cass4Q08EC4 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cass4Q08EC4 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cass4Q08EC4 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cass4Q08EC4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cass4Q08EC4 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cass4Q08EC4 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cass4Q08EC4 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cass4Q08EC4 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cass4Q08EC4 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cass4Q08EC4 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cass4Q08EC4 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cass4Q08EC4 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cass4Q08EC4 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cass4Q08EC4 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cass4Q08EC4 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cass4Q08EC4 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cass4Q08EC4 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cass4Q08EC4 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cass4Q08EC4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cass4Q08EC4 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cass4Q08EC4 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cass4Q08EC4 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cass4Q08EC4 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cass4Q08EC4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cass4Q08EC4 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cass4Q08EC4 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cass4Q08EC4 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cass4Q08EC4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cass4Q08EC4 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cass4Q08EC4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cass4Q08EC4 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cass4Q08EC4 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cass4Q08EC4 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cass4Q08EC4 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cass4Q08EC4 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms