Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ssrp1Q08943 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ssrp1Q08943 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ssrp1Q08943 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ssrp1Q08943 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ssrp1Q08943 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Ssrp1Q08943 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ssrp1Q08943 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ssrp1Q08943 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ssrp1Q08943 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Ssrp1Q08943 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ssrp1Q08943 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ssrp1Q08943 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ssrp1Q08943 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ssrp1Q08943 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ssrp1Q08943 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ssrp1Q08943 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ssrp1Q08943 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ssrp1Q08943 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ssrp1Q08943 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Ssrp1Q08943 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ssrp1Q08943 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ssrp1Q08943 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ssrp1Q08943 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ssrp1Q08943 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ssrp1Q08943 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ssrp1Q08943 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ssrp1Q08943 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ssrp1Q08943 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ssrp1Q08943 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ssrp1Q08943 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ssrp1Q08943 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ssrp1Q08943 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ssrp1Q08943 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ssrp1Q08943 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ssrp1Q08943 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ssrp1Q08943 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ssrp1Q08943 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ssrp1Q08943 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ssrp1Q08943 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ssrp1Q08943 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ssrp1Q08943 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ssrp1Q08943 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Ssrp1Q08943 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ssrp1Q08943 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ssrp1Q08943 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ssrp1Q08943 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ssrp1Q08943 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Ssrp1Q08943 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ssrp1Q08943 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ssrp1Q08943 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ssrp1Q08943 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ssrp1Q08943 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ssrp1Q08943 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ssrp1Q08943 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ssrp1Q08943 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ssrp1Q08943 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ssrp1Q08943 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ssrp1Q08943 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ssrp1Q08943 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ssrp1Q08943 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ssrp1Q08943 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Ssrp1Q08943 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ssrp1Q08943 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ssrp1Q08943 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Ssrp1Q08943 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ssrp1Q08943 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Ssrp1Q08943 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ssrp1Q08943 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ssrp1Q08943 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ssrp1Q08943 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ssrp1Q08943 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ssrp1Q08943 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ssrp1Q08943 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ssrp1Q08943 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ssrp1Q08943 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ssrp1Q08943 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ssrp1Q08943 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ssrp1Q08943 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ssrp1Q08943 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ssrp1Q08943 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ssrp1Q08943 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ssrp1Q08943 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ssrp1Q08943 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ssrp1Q08943 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ssrp1Q08943 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ssrp1Q08943 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ssrp1Q08943 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ssrp1Q08943 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ssrp1Q08943 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ssrp1Q08943 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ssrp1Q08943 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ssrp1Q08943 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ssrp1Q08943 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ssrp1Q08943 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ssrp1Q08943 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ssrp1Q08943 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ssrp1Q08943 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ssrp1Q08943 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ssrp1Q08943 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms