Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms