Protein–RNA interactions for Protein: Q05AH6

SPINDOC, SPIN1-docking protein, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINDOCQ05AH6 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPINDOCQ05AH6 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPINDOCQ05AH6 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPINDOCQ05AH6 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPINDOCQ05AH6 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPINDOCQ05AH6 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPINDOCQ05AH6 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SPINDOCQ05AH6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPINDOCQ05AH6 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPINDOCQ05AH6 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPINDOCQ05AH6 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPINDOCQ05AH6 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SPINDOCQ05AH6 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPINDOCQ05AH6 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPINDOCQ05AH6 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPINDOCQ05AH6 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPINDOCQ05AH6 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPINDOCQ05AH6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPINDOCQ05AH6 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPINDOCQ05AH6 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPINDOCQ05AH6 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPINDOCQ05AH6 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPINDOCQ05AH6 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPINDOCQ05AH6 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPINDOCQ05AH6 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPINDOCQ05AH6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPINDOCQ05AH6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPINDOCQ05AH6 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPINDOCQ05AH6 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPINDOCQ05AH6 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPINDOCQ05AH6 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPINDOCQ05AH6 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SPINDOCQ05AH6 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPINDOCQ05AH6 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPINDOCQ05AH6 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPINDOCQ05AH6 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SPINDOCQ05AH6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPINDOCQ05AH6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPINDOCQ05AH6 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPINDOCQ05AH6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPINDOCQ05AH6 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPINDOCQ05AH6 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPINDOCQ05AH6 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPINDOCQ05AH6 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPINDOCQ05AH6 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPINDOCQ05AH6 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPINDOCQ05AH6 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPINDOCQ05AH6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPINDOCQ05AH6 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPINDOCQ05AH6 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPINDOCQ05AH6 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPINDOCQ05AH6 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPINDOCQ05AH6 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPINDOCQ05AH6 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPINDOCQ05AH6 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SPINDOCQ05AH6 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SPINDOCQ05AH6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPINDOCQ05AH6 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPINDOCQ05AH6 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPINDOCQ05AH6 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPINDOCQ05AH6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPINDOCQ05AH6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPINDOCQ05AH6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPINDOCQ05AH6 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPINDOCQ05AH6 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPINDOCQ05AH6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPINDOCQ05AH6 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPINDOCQ05AH6 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SPINDOCQ05AH6 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPINDOCQ05AH6 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SPINDOCQ05AH6 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPINDOCQ05AH6 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPINDOCQ05AH6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPINDOCQ05AH6 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPINDOCQ05AH6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPINDOCQ05AH6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPINDOCQ05AH6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPINDOCQ05AH6 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPINDOCQ05AH6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPINDOCQ05AH6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPINDOCQ05AH6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPINDOCQ05AH6 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPINDOCQ05AH6 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPINDOCQ05AH6 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPINDOCQ05AH6 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SPINDOCQ05AH6 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPINDOCQ05AH6 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPINDOCQ05AH6 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SPINDOCQ05AH6 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPINDOCQ05AH6 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPINDOCQ05AH6 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPINDOCQ05AH6 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPINDOCQ05AH6 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPINDOCQ05AH6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPINDOCQ05AH6 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPINDOCQ05AH6 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPINDOCQ05AH6 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPINDOCQ05AH6 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPINDOCQ05AH6 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPINDOCQ05AH6 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms